RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa16.63■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CYB561A3Q8NBI2 242 aa16.63■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa16.63■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 POTEKPQ9BYX7 375 aa16.63■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SAP130Q9H0E3 1048 aa16.63■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 UCHL1P09936 223 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ERP29P30040 261 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TAP2Q03519 686 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 XKR7Q5GH72 579 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SYNPOQ8N3V7 929 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 OR8S1Q8NH09 359 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ALG8Q9BVK2 526 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 C12orf4Q9NQ89 552 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SCN9AQ15858 1988 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CLDN24A6NM45 220 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 NOTOA8MTQ0 251 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 WASH3PC4AMC7 463 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF208O43345 1280 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 GIPRP48546 466 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 SYPL1Q16563 259 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 PODNL1Q6PEZ8 512 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM239Q8WW34 195 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 FGF13Q92913 245 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 MUL1Q969V5 352 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 H2BFMP0C1H6 154 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 GRPRP30550 384 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TTLL10Q6ZVT0 673 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TIGD4Q8IY51 512 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 HORMAD2Q8N7B1 307 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DHDHQ9UQ10 334 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 KCNK5O95279 499 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 THEGLP0DJG4 465 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 RABIFP47224 123 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DAPP51397 102 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DEFB110Q30KQ9 67 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 LRFN4Q6PJG9 635 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 GPAT4Q86UL3 456 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 OR51L1Q8NGJ5 315 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 OR13F1Q8NGS4 319 aa16.62■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TAPBPO15533 448 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ABLIM3O94929 683 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CAPNS1P04632 268 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 RORAP35398 523 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 PGFP49763 221 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 GBX1Q14549 363 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TCTE1Q5JU00 501 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 DNAJA3Q96EY1 480 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 HOXD1Q9GZZ0 328 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 RNF121Q9H920 327 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 THSD1Q9NS62 852 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 COPZ2Q9P299 210 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 PRAMEF2O60811 474 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 PSMB5P28074 263 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 HOXC12P31275 282 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 PTGER1P34995 402 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 VWA5B2Q8N398 1253 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CLEC4EQ9ULY5 219 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 HTR3EA5X5Y0 456 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 PPP1R3DO95685 299 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CTXN1P60606 82 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 HMBOX1Q6NT76 420 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF619Q8N2I2 560 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 RHOXF1Q8NHV9 184 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ASB6Q9NWX5 421 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CARD8Q9Y2G2 431 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CASRP41180 1078 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM164Q5U3C3 297 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 OLIG1Q8TAK6 271 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 CASTOR1Q8WTX7 329 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 NECTIN4Q96NY8 510 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 TIMM29Q9BSF4 260 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 KATNBL1Q9H079 304 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 P2RY12Q9H244 342 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa16.61■□□□□ 0.25
SCARB2-201ENST00000264896 ALG5Q9Y673 324 aa16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms