RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263897.9

USE1-201, Transcript of unconventional SNARE in the ER 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USE1, Length 843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1-201ENST00000263897 GPC1P35052 558 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 ASMTP46597 345 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 GFRA1P56159 465 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 WNT3P56703 355 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 KRTAP10-9P60411 292 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 HSPB3Q12988 150 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 KRT71Q3SY84 523 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 NAXEQ8NCW5 288 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 AGR3Q8TD06 166 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 PPP3R2Q96LZ3 170 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 DOCK7Q96N67 2140 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 MCCC2Q9HCC0 563 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 NTMQ9P121 344 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa14.61□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 TMEM114B3SHH9 223 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 B4DXG7 233 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 SYT5O00445 386 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 DVL2O14641 736 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 PEX11AO75192 247 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 CAPN3P20807 821 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 DPP4P27487 766 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 GABRA3P34903 492 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 EVI2BP34910 448 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 MAP3K8P41279 467 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 DLX5P56178 289 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 ZNF844Q08AG5 666 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 XKR7Q5GH72 579 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 IFNEQ86WN2 208 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 C3orf30Q96M34 536 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 TRIB1Q96RU8 372 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 C3orf14Q9HBI5 128 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 GIMAP2Q9UG22 337 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 KCNN3Q9UGI6 736 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 RAB21Q9UL25 225 aa14.6□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 MPDZO75970 2070 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 SCO2O43819 266 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 BMP5P22003 454 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 MAPK1P28482 360 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 STARP49675 285 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 ZNF136P52737 540 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 PRKAG1P54619 331 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 RCAN2Q14206 197 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 C6orf136Q5SQH8 315 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 NUP43Q8NFH3 380 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 GPR151Q8TDV0 419 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 DSN1Q9H410 356 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 FLRT3Q9NZU0 649 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
USE1-201ENST00000263897 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 C17orf51A8MQB3 221 aa14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 EMC8O43402 210 aa14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 NKX2-2O95096 273 aa14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 KCNH1O95259 989 aa14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 CHMP24386 653 aa14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 SERPINB4P48594 390 aa14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 SRYQ05066 204 aa14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 MLC1Q15049 377 aa14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 CES4AQ5XG92 561 aa14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 AAGABQ6PD74 315 aa14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 ARSKQ6UWY0 536 aa14.58□□□□□ -0.08
USE1-201ENST00000263897 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms