RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260054.8

CCDC90B-201, Transcript of coiled-coil domain containing 90B, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC90B, Length 1,688 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90B-201ENST00000260054 FCMRO60667 390 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 H6PDO95479 791 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 AK1P00568 194 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 NR2F1P10589 423 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 RBBP4Q09028 425 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 SCARB2Q14108 478 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 GPAT3Q53EU6 434 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 HPS6Q86YV9 775 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 MICU2Q8IYU8 434 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 TAGAPQ8N103 731 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 SLC22A8Q8TCC7 542 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 MCUR1Q96AQ8 359 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ZNF350Q9GZX5 532 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 GPR83Q9NYM4 423 aa14.57□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 TSPAN2O60636 221 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 IL33O95760 270 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ALPPP05187 535 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 PCGF2P35227 344 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 SOX3P41225 446 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 PSPHP78330 225 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 DECR1Q16698 335 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 MEP1AQ16819 746 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 SPATS1Q496A3 300 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 DESI1Q6ICB0 168 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 BEST3Q8N1M1 668 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 SLC15A4Q8N697 577 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 DIO2Q92813 273 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 SLC38A1Q9H2H9 487 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 EGFL7Q9UHF1 273 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ZZEF1O43149 2961 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 TMEM247A6NEH6 219 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 STX11O75558 287 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 REM1O75628 298 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 CEACAM4O75871 244 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 OR6B1O95007 311 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 FBXO45P0C2W1 286 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 HTR1EP28566 365 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 SSR4P51571 173 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 CRISP3P54108 245 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 CXADRP78310 365 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 CHRNEQ04844 493 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 FXNQ16595 210 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 REEP3Q6NUK4 255 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 HIPK4Q8NE63 616 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 AGAP4Q96P64 663 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ADOQ96SZ5 270 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 STMN3Q9NZ72 180 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 MKLN1Q9UL63 735 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 C5orf58C9J3I9 102 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 UGT2B11O75310 529 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 PPM1BO75688 479 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 PGM3O95394 542 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 NCK1P16333 377 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ME2P23368 584 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 IL12BP29460 328 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 AQP1P29972 269 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 KRT20P35900 424 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 FBXW4P57775 412 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 KCNJ2P63252 427 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 HPCAP84074 193 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 VEZF1Q14119 521 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 GNA13Q14344 377 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ABHD17BQ5VST6 288 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 LINC00696Q6ZRV3 163 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ASB15Q8WXK1 588 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 ZG16BQ96DA0 208 aa14.55□□□□□ -0.08
CCDC90B-201ENST00000260054 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms