RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258796.11

TTYH3-201, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTYH3, Length 4,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-201ENST00000258796 KDM4DQ6B0I6 523 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 ALG1LQ6GMV1 187 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 TMEM205Q6UW68 189 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 PRRC1Q96M27 445 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 TRAV18A0A075B6X5 111 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 PRAF2O60831 178 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 GPR143P51810 404 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 HOXC5Q00444 222 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 CDK10Q15131 360 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 TRIM46Q7Z4K8 759 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 OR8J2Q8NGG1 315 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 CERS4Q9HA82 394 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 KLHL42Q9P2K6 505 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 PADI2Q9Y2J8 665 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 ANTXRLA6NF34 631 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 SCG5P05408 212 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 SFTPBP07988 381 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 C6P13671 934 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 PTPN6P29350 595 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 SLC14A2Q15849 920 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 SPNS2Q8IVW8 549 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 SERPINA12Q8IW75 414 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 DNAJA3Q96EY1 480 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 ORAI3Q9BRQ5 295 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 CLEC4EQ9ULY5 219 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 SLC7A7Q9UM01 511 aa18.62■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 UNCXA6NJT0 531 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 GOSR2O14653 212 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 PPP1R3DO95685 299 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 CSTBP04080 98 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 PRKCAP17252 672 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 RBMXP38159 391 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 GALEQ14376 348 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 MBTPS1Q14703 1052 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 PRRT3Q5FWE3 981 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 XKR7Q5GH72 579 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 ALG10BQ5I7T1 473 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 C3P1Q6ZMU1 363 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 TMEM163Q8TC26 289 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 KCNN1Q92952 543 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 SGIP1Q9BQI5 828 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 ACTRT3Q9BYD9 372 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 SLC22A5O76082 557 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 ACP2P11117 423 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 MGAT3Q09327 533 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 OLIG1Q8TAK6 271 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 SMPDL3BQ92485 455 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 MSLNLQ96KJ4 702 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 CMKLR1Q99788 373 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 GFRA2O00451 464 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 NCR1O76036 304 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 AMY2AP04746 511 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 ARAFP10398 606 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 PTGER1P34995 402 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 PCGF3Q3KNV8 242 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 AMZ1Q400G9 498 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 TMEM25Q86YD3 366 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 OR5AR1Q8NGP9 310 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 MAFIPQ8WZ33 124 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 NPR2P20594 1047 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 AHRP35869 848 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 NRG3P56975 720 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 IL20RBQ6UXL0 311 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 SLC35B4Q969S0 331 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 SYT17Q9BSW7 474 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 PINK1Q9BXM7 581 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 OR8D2Q9GZM6 311 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 PKD1L3Q7Z443 1732 aa18.61■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 ANKRD34BA5PLL1 514 aa18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 CASC3O15234 703 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 SULT1C4O75897 302 aa18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 MT-ND4P03905 459 aa18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 BLKP51451 505 aa18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 SLC28A3Q9HAS3 691 aa18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 BABAM2Q9NXR7 383 aa18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 A0A1W2PQY0 241 aa18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 B4DGG1 531 aa18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 FXYD1O00168 92 aa18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 FGF18O76093 207 aa18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 PET100P0DJ07 73 aa18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 INAVAQ3KP66 663 aa18.6■□□□□ 0.57
TTYH3-201ENST00000258796 ANKRD34AQ69YU3 496 aa18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms