RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 VipP32648 170 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ska3Q8C263 411 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcnmb1Q8CAE3 191 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FlcnQ8QZS3 579 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd207Q8VBX4 331 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Plet1Q8VEN2 237 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr53Q8VGL8 312 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr649Q8VGW1 312 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 BlvraQ9CY64 295 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Praf2Q9JIG8 178 aa16.08■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 D3Ertd254eA0A0G2JEM5 796 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ssc4dA1L0T3 586 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam217bA2AJW5 387 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r58G3X9U3 310 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk5r2O35926 369 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ulk1O70405 1051 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lire1P11260 357 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1080Q7TR67 313 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr598Q7TRR2 319 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Commd7Q8BG94 200 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf592Q8BHZ4 1262 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spon2Q8BMS2 330 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zcchc3Q8BPK2 400 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdfy2Q8BUB4 400 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Clec4a3Q8JZX6 237 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r206Q8R277 312 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ScgnQ91WD9 276 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gpx6Q91WR8 221 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdhac1Q91Y10 964 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddx28Q9CWT6 540 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc107Q9DCC3 242 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spry1Q9QXV9 313 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hipk2Q9QZR5 1196 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Itgb6Q9Z0T9 787 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CrnnD3YUU6 520 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm8973D3YX71 104 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nmur1O55040 428 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btg4O70552 250 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prph2P15499 346 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddx6P54823 483 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trappc13Q3TIR1 417 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dcp1bQ3U564 578 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PmlQ60953 885 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dpp10Q6NXK7 797 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acsm4Q80W40 580 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Trmt61aQ80XC2 290 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PstkQ8BP74 359 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serpina11Q8CIE0 424 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rdh10Q8VCH7 341 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1346Q8VGH6 313 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr586Q8VH13 317 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Izumo2Q9DA16 220 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spaca1Q9DA48 305 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ift43Q9DA69 206 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cpn2Q9DBB9 547 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Slc38a3Q9DCP2 505 aa16.07■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp981A2A8V7 445 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mgl2A9XX86 381 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2610021A01RikE9Q0Q3 834 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gcm2O09102 504 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tcfl5Q32NY8 489 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdk10Q3UMM4 360 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm732Q3V0P9 516 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mup20Q5FW60 181 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 UnklQ5FWH2 727 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Orm1Q60590 207 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nsg1Q62092 185 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Enpp3Q6DYE8 874 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ugt2b37Q8VCN3 530 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mzt2Q9CQ25 159 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sp2Q9D2H6 612 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cldn6Q9Z262 219 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Igkv10-95A0A0G2JFY3 115 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cela3aA2A9U8 283 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Esp31A8R0W3 114 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf382B2RXC5 579 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn1r20K7N778 303 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm4141K9J7H2 306 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cntn1P12960 1020 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 S100a6P14069 89 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Guca1aP43081 202 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ankdd1bQ14DN9 521 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmem248Q3TBN1 314 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cdc123Q8CII2 336 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spns1Q8R0G7 528 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FggQ8VCM7 436 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Exo5Q9CXP9 373 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cmtm8Q9CZR4 173 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Lrrc69Q9D9Q0 347 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fgf20Q9ESL9 211 aa16.06■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Unc80Q8BLN6 3261 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ighv6-6A0A075B5T3 119 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mfsd13bA0A1L1SUA2 455 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp534A2A7A1 661 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Wdr76A6PWY4 622 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Skint9A7TZG3 319 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pcdh1F7BJK1 1077 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rnpepl1G5E872 720 aa16.05■□□□□ 0.16
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Klrg1O88713 188 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.7 ms