RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592923.5

CNN1-210, Transcript of calponin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN1, Length 1,848 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN1-210ENST00000592923 STSP08842 583 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 INHBBP09529 407 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 ALOX5P09917 674 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 ADORA3P0DMS8 318 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 NT5EP21589 574 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 NR4A1P22736 598 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 IFNGR2P38484 337 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 SLC15A1P46059 708 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 ST3GAL4Q11206 333 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 DEFB110Q30KQ9 67 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 CASP12Q6UXS9 341 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 Q6ZNX1 250 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 ZG16BQ96DA0 208 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.65□□□□□ -0.06
CNN1-210ENST00000592923 FRS3O43559 492 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 TPST2O60704 377 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 CBFA2T3O75081 653 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 CYP7B1O75881 506 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 CCNYL3P0C7X3 344 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 CD36P16671 472 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 ALDH4A1P30038 563 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 AVPR1BP47901 424 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 SKP1P63208 163 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 ST3GAL3Q11203 375 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 DUSP8Q13202 625 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 MOGQ16653 247 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 TIGD6Q17RP2 521 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 ARL14Q8N4G2 192 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 CRELD1Q96HD1 420 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 SDF2Q99470 211 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 CTPS2Q9NRF8 586 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 STARD5Q9NSY2 213 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 MKLN1Q9UL63 735 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 A0A087WUU8 490 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 AGAP5A6NIR3 686 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 AP3D1O14617 1153 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 KIAA0513O60268 411 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 OR5F1O95221 314 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 PROS1P07225 676 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 MGAT2Q10469 447 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 DCST2Q5T1A1 773 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 ZNF619Q8N2I2 560 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 CLIP4Q8N3C7 705 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 LMX1AQ8TE12 382 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 CTHRC1Q96CG8 243 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 PALMDQ9NP74 551 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.64□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 BLACEA4D250 179 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 FAM170BA6NMN3 283 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 M0R082 166 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 COQ9O75208 318 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 ENTPD6O75354 484 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 SLC35E2P0CK97 266 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 TNNI3P19429 210 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 MAP3K8P41279 467 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 OCLNQ16625 522 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 MEDAGQ5VYS4 303 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 SHISA5Q8N114 240 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 COX18Q8N8Q8 333 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 NDNFQ8TB73 568 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 BORCS5Q969J3 196 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 TCTN2Q96GX1 697 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 GPA33Q99795 319 aa14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
CNN1-210ENST00000592923 DOLKQ9UPQ8 538 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.9 ms