RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ESRRBO95718 433 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CRHP06850 196 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYGSP22914 178 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 IL12BP29460 328 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PCYT1AP49585 367 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 EFR3AQ14156 821 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL2A1Q16548 175 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ACKR1Q16570 336 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 FIG4Q92562 907 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 DTNBP1Q96EV8 351 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL19Q99731 98 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 MED18Q9BUE0 208 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF226Q9NYT6 803 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 NINJ2Q9NZG7 142 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 IL3P08700 152 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT20P35900 424 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 CLDN15P56746 228 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 SIRPAP78324 504 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A5Q01650 507 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2A2Q6IF42 318 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4K17Q8NGC6 315 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4N2Q8NGD1 307 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PERPQ96FX8 193 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PGM2Q96G03 612 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 HS3ST6Q96QI5 342 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGQQ9BRB3 760 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 FOLH1BQ9HBA9 442 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS29Q9UBQ0 182 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPS1Q9UHF7 1281 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 MED12LQ86YW9 2145 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 H0YC42 278 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4F21O95013 312 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SBK3P0C264 359 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CHN1P15882 459 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PCSK6P29122 969 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PHBP35232 272 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 UGT2B10P36537 528 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CHMP1BQ7LBR1 199 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF550Q7Z398 422 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ERP27Q96DN0 273 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MARK4Q96L34 752 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 NMRK1Q9NWW6 199 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MCM8Q9UJA3 840 aa23.14■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM64A6NGJ6 449 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM64BA6NI03 449 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MT66 165 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SCO2O43819 266 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 POU2F1P14859 743 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PNLIPRP2P54317 469 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 RAE1P78406 368 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS57Q6UWY2 283 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 FADS6Q8N9I5 356 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2M3Q8NG83 312 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 DSN1Q9H410 356 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MANBAO00462 879 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CGAP01215 116 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PEPDP12955 493 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 FPR1P21462 350 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 LOXP28300 417 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 EVI2BP34910 448 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 RAET1LQ5VY80 246 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 C22orf34Q6ZV56 151 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM151AQ8N4L1 468 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MEIOBQ8N635 442 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 CDYL2Q8N8U2 506 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 OR7G2Q8NG99 324 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MTBPQ96DY7 904 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MDFIQ99750 246 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 BDH2Q9BUT1 245 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ELOVL5Q9NYP7 299 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDH7O60245 1069 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 INHBAP08476 426 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 COL6A2P12110 1019 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 HK1P19367 917 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 HSD17B3P37058 310 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 PSPHP78330 225 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5M1Q8NGP8 315 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
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