RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	NUP43	Q8NFH3	380 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	SARAF	Q96BY9	339 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	GNRHR2	Q96P88	292 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	CBLC	Q9ULV8	474 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		18.35	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	PTPN13	Q12923	2485 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1W2PRB8	838 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	ADAM10	O14672	748 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	GNB5	O14775	395 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	SNPH	O15079	494 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	EMC8	O43402	210 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	CLDN8	P56748	225 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	C21orf58	P58505	322 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	DECR1	Q16698	335 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	HDX	Q7Z353	690 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	COQ8B	Q96D53	544 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	UBQLN3	Q9H347	655 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	NTM	Q9P121	344 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	TRAPPC6A	O75865	159 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	LBP	P18428	481 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	PTPN6	P29350	595 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	TRPC1	P48995	793 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	PRR5	P85299	388 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GAB1	Q13480	694 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	TOMM20	Q15388	145 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GXYLT1	Q4G148	440 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	WLS	Q5T9L3	541 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	C2orf72	A6NCS6	295 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	HDAC3	O15379	428 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	KCNH1	O95259	989 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	HPN	P05981	417 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	CYP4B1	P13584	511 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GABRA3	P34903	492 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	DIO3	P55073	304 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	EMC4	Q5J8M3	183 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	XKRX	Q6PP77	449 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GPR151	Q8TDV0	419 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	NUDT8	Q8WV74	236 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	RNF138	Q8WVD3	245 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	GIMAP5	Q96F15	307 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	DUSP26	Q9BV47	211 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	DPY30	Q9C005	99 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	NKX2-2	O95096	273 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	IL33	O95760	270 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	AGA	P20933	346 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	RFX3	P48380	749 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	PRIM2	P49643	509 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	OCRL	Q01968	901 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	ART3	Q13508	389 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PSME3-209	ENST00000589469	PGS1	Q32NB8	556 aa		18.31	■□□□□ 0.52

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