RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PRAMEF7	Q5VXH5	474 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	REEP3	Q6NUK4	255 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CLHC1	Q8NHS4	586 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	HERVK_113	Q902F9	699 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SMARCD2	Q92925	531 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	NEIL2	Q969S2	332 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	MUL1	Q969V5	352 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	RGMA	Q96B86	450 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF607	Q96SK3	696 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	MBOAT4	Q96T53	435 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PITX2	Q99697	317 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CD84	Q9UIB8	345 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CCL26	Q9Y258	94 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	HEBP2	Q9Y5Z4	205 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289		V9GYQ6	96 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PCM1	Q15154	2024 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	MYO10	Q9HD67	2058 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PLXNA2	O75051	1894 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ISPD	A4D126	451 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CLCA1	A8K7I4	914 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SH3BP5	O60239	455 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNB2	O95067	398 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CLIC3	O95833	236 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	AGR2	O95994	175 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	MT-ND1	P03886	318 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	IFNW1	P05000	195 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ALOX5	P09917	674 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ERG	P11308	486 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	GJA1	P17302	382 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ELK4	P28324	431 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	ACADL	P28330	430 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFS1	P28331	727 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PCSK6	P29122	969 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PPP2R1B	P30154	601 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	PTGER1	P34995	402 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	CA5A	P35218	305 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PTPRM-215	ENST00000583289	GGT2	P36268	569 aa		4.26	□□□□□ -1.73

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