RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF747Q9BV97 191 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ITPAQ9BY32 194 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 C12orf49Q9H741 205 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 NPAP1Q9NZP6 1156 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 PLCE1Q9P212 2302 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A1W2PR48 441 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 OR2M5A3KFT3 312 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 LRP5LA4QPB2 252 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 H3BML4 177 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 GOLGA8RI6L899 631 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ABCD4O14678 606 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 TGFB1P01137 390 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 COL6A2P12110 1019 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 FCGR2AP12318 317 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF23P17027 643 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 EPORP19235 508 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 GRK2P25098 689 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 AGTR1P30556 359 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 IL2RGP31785 369 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 DEKP35659 375 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ARFIP2P53365 341 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 CTBP2P56545 445 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 CDKL1Q00532 357 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 LGALS3BPQ08380 585 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 SPOCK1Q08629 439 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 PLCXD2Q0VAA5 305 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ANKRD22Q5VYY1 191 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ARMC3Q5W041 872 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 OR4C11Q6IEV9 310 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 GALNT12Q8IXK2 581 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 MUC15Q8N387 334 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 RNF175Q8N4F7 328 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 FADS6Q8N9I5 356 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 MCUQ8NE86 351 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ANKRD7Q92527 254 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 FOXN4Q96NZ1 517 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 SERPINB12Q96P63 405 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 DHRS9Q9BPW9 319 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 EHD1Q9H4M9 534 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 NGBQ9NPG2 151 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 XPR1Q9UBH6 696 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ASB4Q9Y574 426 aa6.79□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ESYT3A0FGR9 886 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 SYCE3A1L190 88 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 PLPP1O14494 284 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 PGRMC2O15173 223 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 TAPBPO15533 448 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 TMPRSS11DO60235 418 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 AHSGP02765 367 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 HK1P19367 917 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 CASP2P42575 452 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 PDLIM4P50479 330 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 TERF1P54274 439 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 HILS1P60008 231 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 MGAT2Q10469 447 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 KIF5AQ12840 1032 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 FBXO48Q5FWF7 155 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 LCE1DQ5T752 114 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 RAET1LQ5VY80 246 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 RINLQ6ZS11 566 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 OR2M3Q8NG83 312 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 OR7G1Q8NGA0 311 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 ESAMQ96AP7 390 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-217ENST00000580654 SLC35A4Q96G79 324 aa6.78□□□□□ -1.32
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