RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	POC5	Q8NA72	575 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	OR2L3	Q8NG85	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	HSPH1	Q92598	858 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CAVIN3	Q969G5	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	OR1F2P	Q96R84	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MED18	Q9BUE0	208 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CALHM2	Q9HA72	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PARVA	Q9NVD7	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	HPF1	Q9NWY4	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GLOD5	A6NK44	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KCNK1	O00180	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PSMD9	O00233	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	AP2A2	O94973	939 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RCBTB2	O95199	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CHRM4	P08173	479 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC25A16	P16260	332 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SAT1	P21673	171 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PTPN3	P26045	913 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CXCR5	P32302	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CLCN2	P51788	898 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DSCR9	P59020	149 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	XIAP	P98170	497 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GAB1	Q13480	694 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NRF1	Q16656	503 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RTL4	Q6ZR62	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	FAM168A	Q92567	244 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KAT2A	Q92830	837 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	UCN3	Q969E3	161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PGAM5	Q96HS1	289 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	OR2A5	Q96R48	311 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRIM25-208	ENST00000574234	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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