RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561726.1

TNRC6A-208, Transcript of trinucleotide repeat containing 6A, humanhuman

TSL 4

Gene TNRC6A, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6A-208ENST00000561726 SNX3O60493 162 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 GRAP2O75791 330 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 BCAR3O75815 825 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 NDUFB4O95168 129 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 NTN1O95631 604 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 RAF1P04049 648 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 SERPINE2P07093 398 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 STSP08842 583 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 CT45A8P0DMV1 189 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 CT45A9P0DMV2 189 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 CBSLP0DN79 551 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 MLNP12872 115 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 ZNF23P17027 643 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 TSPAN8P19075 237 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 CD58P19256 250 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 MMP11P24347 488 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 SRD5A2P31213 254 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 CBSP35520 551 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 AHRP35869 848 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 CRYBB2P43320 205 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 CBX5P45973 191 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 UQCRFS1P47985 274 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 ACLYP53396 1101 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 CD81P60033 236 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 PLP1P60201 277 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 PRPS1P60891 318 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 SP3Q02447 781 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 IFFO1Q0D2I5 559 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 STX5Q13190 355 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 CRMP1Q14194 572 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 HNF4GQ14541 408 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 ZSWIM7Q19AV6 140 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 Q4G0T1 1027 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 CT45A2Q5DJT8 189 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 FAM69BQ5VUD6 431 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 RNLSQ5VYX0 342 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 MFSD14CQ5VZR4 134 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC22A10Q63ZE4 541 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 AWAT2Q6E213 333 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC8B1Q6J4K2 584 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 C11orf63Q6NUN7 778 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 FUT10Q6P4F1 479 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 VITQ6UXI7 678 aa3.12□□□□□ -1.91
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TNRC6A-208ENST00000561726 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
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TNRC6A-208ENST00000561726 PARGQ86W56 976 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC26A11Q86WA9 606 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 KMT5CQ86Y97 462 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 TBC1D10CQ8IV04 446 aa3.12□□□□□ -1.91
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TNRC6A-208ENST00000561726 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.12□□□□□ -1.91
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TNRC6A-208ENST00000561726 THAP8Q8NA92 274 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 FBXO36Q8NEA4 188 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 OR2L3Q8NG85 312 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 OR6M1Q8NGM8 313 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 OR4D5Q8NGN0 318 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 OR13C3Q8NGS6 347 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 SMPDL3AQ92484 453 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 SMPDL3BQ92485 455 aa3.12□□□□□ -1.91
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TNRC6A-208ENST00000561726 MED30Q96HR3 178 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 FUCA2Q9BTY2 467 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 OR2B2Q9GZK3 357 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 MIS12Q9H081 205 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 Q9H8V8 135 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 IL1RL2Q9HB29 575 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 GKN1Q9NS71 199 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 PTTG2Q9NZH5 202 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 NPAP1Q9NZP6 1156 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC17A7Q9P2U7 560 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 PHF11Q9UIL8 331 aa3.12□□□□□ -1.91
TNRC6A-208ENST00000561726 IKZF2Q9UKS7 526 aa3.12□□□□□ -1.91
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