RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561405.1

UBE2CP4-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP4, Length 535 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP4-201ENST00000561405 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ACVR2AP27037 513 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PTPN6P29350 595 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 NTSP30990 170 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PTGER4P35408 488 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MC3RP41968 323 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SERPINB4P48594 390 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PNLIPRP2P54317 469 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 GAS1P54826 345 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CORO7P57737 925 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 NNATQ16517 81 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 KRT71Q3SY84 523 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF385BQ569K4 471 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ACAD11Q709F0 780 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPRMLQ8N4K4 120 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ASB5Q8WWX0 329 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMBIM1Q969X1 311 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MTERF3Q96E29 417 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ELP4Q96EB1 424 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PGM2Q96G03 612 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 COL21A1Q96P44 957 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 BBS4Q96RK4 519 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC6A15Q9H2J7 730 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 REEP4Q9H6H4 257 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 HAO1Q9UJM8 370 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 FBN2P35556 2912 aa6.77□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ABCA4P78363 2273 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 C19orf84I3L1E1 186 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 TM9SF1O15321 606 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PDPK1O15530 556 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 NME6O75414 186 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 REM1O75628 298 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SERPINE1P05121 402 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 GLI4P10075 376 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 BCKDHAP12694 445 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 GABRA1P14867 456 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 IGFBP2P18065 325 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 GDF1P27539 372 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CHRNB4P30926 498 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 KIR3DL1P43629 444 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ASMTP46597 345 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 NUP107P57740 925 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 C21orf58P58505 322 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 TFF3Q07654 80 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 EFR3AQ14156 821 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MPP2Q14168 576 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 MLC1Q15049 377 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SMU1Q2TAY7 513 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 C6orf136Q5SQH8 315 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SH2D4BQ5SQS7 431 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 WLSQ5T9L3 541 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 VASNQ6EMK4 673 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMEM107Q6UX40 140 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 LRIG3Q6UXM1 1119 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 CROCCP2Q86T23 111 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 NUDCD3Q8IVD9 361 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 WDSUB1Q8N9V3 476 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 RND1Q92730 232 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SDCCAG3Q96C92 435 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 TMCO6Q96DC7 493 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 C3orf30Q96M34 536 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 GNRHR2Q96P88 292 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ZIM3Q96PE6 472 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 TSSK3Q96PN8 268 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 TIMP4Q99727 224 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 LDAHQ9H6V9 325 aa6.76□□□□□ -1.33
UBE2CP4-201ENST00000561405 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms