RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 GPR151Q8TDV0 419 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 HGDQ93099 445 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 RELTQ969Z4 430 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 SARAFQ96BY9 339 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 STACQ99469 402 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 DUSP22Q9NRW4 184 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 AIG1Q9NVV5 245 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.49□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRK2Q5S007 2527 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 DUXAA6NLW8 204 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM166BA8MTA8 275 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 UBDO15205 165 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 TSPAN2O60636 221 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 DIAPH2O60879 1101 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 NKX2-2O95096 273 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 IL33O95760 270 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 AGR2O95994 175 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 IGHG3P01860 377 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 S100A3P33764 101 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 CA7P43166 264 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 MAN2A2P49641 1150 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 CDK9P50750 372 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 CORO7P57737 925 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNK10P57789 538 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 FOXO1Q12778 655 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.091e-7■■■■□ 25.6
RABGGTA-205ENST00000558534 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 CMPK2Q5EBM0 449 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM251Q8N6I4 163 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 COX18Q8N8Q8 333 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 CKAP2Q8WWK9 683 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 STON2Q8WXE9 905 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC9A6Q92581 669 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ADOQ96SZ5 270 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ACTRT3Q9BYD9 372 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 EXO5Q9H790 373 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ACKR4Q9NPB9 350 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 EQTNQ9NQ60 294 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 MRGBPQ9NV56 204 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.48□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 G3V3Y1 287 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 AQP7O14520 342 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRTM2O43300 516 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 UGT2B11O75310 529 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 CBR3O75828 277 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 SASH3O75995 380 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 C6orf47O95873 294 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 AK1P00568 194 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 IL6P05231 212 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 GDF1P27539 372 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 GABRA3P34903 492 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 SOAT1P35610 550 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 RFC3P40938 356 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGEA5P43359 124 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 RNFT1Q5M7Z0 435 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 RPTNQ6XPR3 784 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 SIMC1Q8NDZ2 872 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM57AQ8TBR7 257 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ADAMTS15Q8TE58 950 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 JADE3Q92613 823 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 TCF7L2Q9NQB0 619 aa14.47□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A0G2JMM0 328 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1B0GVC2 190 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1W2PPB8 328 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A1W2PRS3 328 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 FIGNL2A6NMB9 653 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 KIR3DP1A8MWS1 328 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 SNPHO15079 494 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ICOSLGO75144 302 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC22A3O75751 556 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP6V1C1P21283 382 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 SMSP52788 366 aa14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
RABGGTA-205ENST00000558534 GAB1Q13480 694 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms