RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543184.5

PRAME-214, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,758 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-214ENST00000543184 ZNF222Q9UK12 451 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 BDP1A6H8Y1 2624 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 LEUTXA8MZ59 168 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 C1QBP02746 253 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 C8orf89P0DMQ9 161 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 TIMP2P16035 220 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 NNMTP40261 264 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 OCLNQ16625 522 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 NXPE4Q6UWF7 544 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 KRT74Q7RTS7 529 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 KLBQ86Z14 1044 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 SFTPA1Q8IWL2 248 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 FAM26EQ8N5C1 309 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 GLYATL1Q969I3 302 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 MS4A3Q96HJ5 214 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 EVA1BQ9NVM1 165 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 ING3Q9NXR8 418 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 A0A0A6YYJ9 748 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 A8MUA0 341 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 MTNR1AP48039 350 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 SOX9P48436 509 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 EVX1P49640 407 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 BNC1Q01954 994 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 POU4F3Q15319 338 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 OR8H3Q8N146 312 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 ANKK1Q8NFD2 765 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 OR5AR1Q8NGP9 310 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 RASSF5Q8WWW0 418 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 TM4SF18Q96CE8 201 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 MED30Q96HR3 178 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 TMEM43Q9BTV4 400 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 STMN3Q9NZ72 180 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 EXTL2Q9UBQ6 330 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 DOCK8Q8NF50 2099 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 GABRPO00591 440 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 TMPRSS11DO60235 418 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 ZNF250P15622 560 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 FUT1P19526 365 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 CCT3P49368 545 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 SLC9B2Q86UD5 537 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 CCDC28AQ8IWP9 274 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 ANKRD53Q8N9V6 530 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 OMA1Q96E52 524 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 TTTY10Q9BZA0 68 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 S1PR5Q9H228 398 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 TMEM245Q9H330 911 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 MED20Q9H944 212 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 EQTNQ9NQ60 294 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 DPP7Q9UHL4 492 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 SLC25A13Q9UJS0 675 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 PPIL1Q9Y3C6 166 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 PDPK1O15530 556 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 SOD1P00441 154 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 VIPR1P32241 457 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 ATP6V1E1P36543 226 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 GPR4P46093 362 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 CLDN20P56880 219 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 OR10A3P58181 314 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 GPR176Q14439 515 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 LY6G5CQ5SRR4 150 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 OR11H4Q8NGC9 324 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 DOK4Q8TEW6 326 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 NEURL3Q96EH8 262 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 NDOR1Q9UHB4 597 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 TAC3Q9UHF0 121 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 HS3ST2Q9Y278 367 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 SPEF1Q9Y4P9 236 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 A0A087WUU8 490 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 A0A1W2PPK0 400 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 H7BY64 318 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 PDE9AO76083 593 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 OLFM2O95897 454 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 LGI1O95970 557 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 GNSP15586 552 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 CXCL3P19876 107 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 TBXA2RP21731 343 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 EPHA5P54756 1037 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 TNK1Q13470 666 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 TOR2AQ5JU69 321 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 MZT2BQ6NZ67 158 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 OR4N4Q8N0Y3 316 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-214ENST00000543184 SMRP1Q8NCR6 262 aa13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms