RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SSR3	Q9UNL2	185 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	AKR7A2	O43488	359 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PLPP2	O43688	288 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NCR1	O76036	304 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	GNRH1	P01148	92 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CD1A	P06126	327 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	C6	P13671	934 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	LAG3	P18627	525 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	GSTM3	P21266	225 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ENPP1	P22413	925 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PSMB5	P28074	263 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	MTNR1A	P48039	350 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	MTNR1B	P49286	362 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ZP1	P60852	638 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CAMK1	Q14012	370 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	GNA13	Q14344	377 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NR4A3	Q92570	626 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	MED30	Q96HR3	178 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NLN	Q9BYT8	704 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NDUFS4	O43181	175 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PTP4A3	O75365	173 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	F3	P13726	295 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ARSB	P15848	533 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	HTR2A	P28223	471 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	BCL6	P41182	706 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	MAP2K3	P46734	347 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SMS	P52788	366 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CSRP2	Q16527	193 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	USP30	Q70CQ3	517 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	OAF	Q86UD1	273 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	IQCH	Q86VS3	1027 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	OTUB2	Q96DC9	234 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	OR2AG1	Q9H205	316 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	EYS	Q5T1H1	3165 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CARNS1	A5YM72	827 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PGRMC2	O15173	223 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	LYRM1	O43325	122 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SLC2A10	O95528	541 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	GUSB	P08236	651 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	NPR2	P20594	1047 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	CFP	P27918	469 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	PKLR	P30613	574 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	DRD3	P35462	400 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	SMIM11A	P58511	58 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CTSC-208	ENST00000533897	FOXK2	Q01167	660 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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