RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	THYN1	Q9P016	225 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CFL2	Q9Y281	166 aa		3.09	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MYH7	P12883	1935 aa		3.09	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	URAD	A6NGE7	173 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC160	A6NGH7	325 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057		E5RGE8	158 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	GOLGA8R	I6L899	631 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	FBP2	O00757	339 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	MCF2L	O15068	1137 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	PFDN6	O15212	129 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	YKT6	O15498	198 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	ZW10	O43264	779 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	ACSL4	O60488	711 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	SERPINB7	O75635	380 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	OR5F1	O95221	314 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	GNA14	O95837	355 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	PAH	P00439	452 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	QDPR	P09417	244 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	GOT1	P17174	413 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	CALB2	P22676	271 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	PSMA3	P25788	255 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	VHL	P40337	213 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	MFAP3	P55082	362 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	IL10RB	Q08334	325 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	MZT1	Q08AG7	82 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	AP1B1	Q10567	949 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	RCN2	Q14257	317 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	ITIH4	Q14624	930 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	MUC21	Q5SSG8	566 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	ATL3	Q6DD88	541 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	BTNL8	Q6UX41	500 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	MACC1	Q6ZN28	852 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	SLC51B	Q86UW2	128 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	FAM219A	Q8IW50	185 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	IFT20	Q8IY31	132 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	MLKL	Q8NB16	471 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	FNDC8	Q8TC99	324 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	NAT14	Q8WUY8	206 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	MGME1	Q9BQP7	344 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	ERP44	Q9BS26	406 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	KCNK13	Q9HB14	408 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	IFNK	Q9P0W0	207 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	NSG2	Q9Y328	171 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	LRRC42	Q9Y546	428 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	TNS2	Q63HR2	1409 aa		3.08	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	LAMB2	P55268	1798 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	EP400	Q96L91	3159 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1W2PPW3	197 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057		A0A1W2PRQ8	180 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	SMIM23	A6NLE4	172 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	ANHX	E9PGG2	379 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	PPIP5K2	O43314	1243 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	STX10	O60499	249 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	KBTBD11	O94819	623 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	BAG2	O95816	211 aa		3.07	□□□□□ -1.92
COPS5-208	ENST00000519057	ANGPTL1	O95841	491 aa		3.07	□□□□□ -1.92

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