RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510157.1

LRBA-208, Transcript of LPS responsive beige-like anchor protein, human

TSL 5

Gene LRBA, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRBA-208	ENST00000510157	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	MEN1	O00255	615 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	SYT5	O00445	386 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	HS6ST1	O60243	411 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	CBFA2T3	O75081	653 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	LGI1	O95970	557 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	ALB	P02768	609 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	ALPL	P05186	524 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	THRB	P10828	461 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	CCL4	P13236	92 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	IL7R	P16871	459 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	PRKAR1B	P31321	381 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	CDH12	P55289	794 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	PSG6	Q00889	435 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	MERTK	Q12866	999 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	EPS8	Q12929	822 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	GK3P	Q14409	553 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	CSRP2	Q16527	193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	VRK2	Q86Y07	508 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	PMM1	Q92871	262 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	FKBP10	Q96AY3	582 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	CNBD2	Q96M20	576 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	RDH12	Q96NR8	316 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	ADI1	Q9BV57	179 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	POLE3	Q9NRF9	147 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	USE1	Q9NZ43	259 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	COPS7A	Q9UBW8	275 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		13.57	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	TTC28	Q96AY4	2481 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	ADAMTS20	P59510	1910 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157		B4E171	279 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157		J3KTA2	159 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157		M0R3H8	397 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	LRP3	O75074	770 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	GADD45G	O95257	159 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	ONECUT2	O95948	504 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	RECK	O95980	971 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	PRKACG	P22612	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	TSPAN7	P41732	249 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	RFX3	P48380	749 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	PPP2R2B	Q00005	443 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	LIN52	Q52LA3	116 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	EIPR1	Q53HC9	387 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	TAGAP	Q8N103	731 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	CYGB	Q8WWM9	190 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	C3orf18	Q9UK00	162 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		13.56	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	SPTB	P11277	2137 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	KIAA0513	O60268	411 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	BRINP1	O60477	761 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	KCNK2	O95069	426 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	THBS1	P07996	1170 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	RAD23A	P54725	363 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	LAPTM4A	Q15012	233 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	PDK3	Q15120	406 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	RFX4	Q33E94	735 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	ZNF605	Q86T29	641 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		13.55	□□□□□ -0.24
LRBA-208	ENST00000510157	OR52J3	Q8NH60	311 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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