RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, human

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-210	ENST00000507965	MED12	Q93074	2177 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	CLCA1	A8K7I4	914 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965		E7ESA3	106 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	UBXN8	O00124	270 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	SYT5	O00445	386 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	GSTA4	O15217	222 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	TMPRSS11D	O60235	418 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	OR10H2	O60403	315 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	ULK1	O75385	1050 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	SUPT3H	O75486	399 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	EED	O75530	441 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM155B	O75949	473 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	AIFM1	O95831	613 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	C1QA	P02745	245 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	GBA	P04062	536 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	CT62	P0C5K7	136 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	NR2F6	P10588	404 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	CD53	P19397	219 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	SSTR1	P30872	391 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	SLCO1A2	P46721	670 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	RAP1GDS1	P52306	607 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC12A2	P55011	1212 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	ARL4C	P56559	192 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	DCAF7	P61962	342 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	IRF9	Q00978	393 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	DR1	Q01658	176 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	TGM3	Q08188	693 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	FOXF2	Q12947	444 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	LSAMP	Q13449	338 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	KEAP1	Q14145	624 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	RCN2	Q14257	317 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	SLMAP	Q14BN4	828 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	RPS6KA2	Q15349	733 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	NTRK2	Q16620	822 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	NRN1L	Q496H8	165 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	EIPR1	Q53HC9	387 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	MROH9	Q5TGP6	573 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	MED27	Q6P2C8	311 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	LUZP2	Q86TE4	346 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	GPR180	Q86V85	440 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	LAS2	Q8IYD9	372 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	OR7G3	Q8NG95	312 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM222B	Q8WU58	562 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	LRRC39	Q96DD0	335 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	C18orf12	Q96KH6	178 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	GNRHR2	Q96P88	292 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	GPR22	Q99680	433 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	RBBP8	Q99708	897 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	CD244	Q9BZW8	370 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	UBQLN3	Q9H347	655 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	ALG9	Q9H6U8	611 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	GALNT8	Q9NY28	637 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	CNIH4	Q9P003	139 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	SPACA6	W5XKT8	324 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	CR1	P17927	2039 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965		A0A0A6YYD5	115 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965		A0A1W2PR48	441 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATXN3-210	ENST00000507965	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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