RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ASCL4Q6XD76 172 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 USP43Q70EL4 1123 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TMED4Q7Z7H5 227 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ZAR1Q86SH2 424 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ITIH5Q86UX2 942 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TDRPQ86YL5 185 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 SYS1Q8N2H4 156 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 FAM222BQ8WU58 562 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM171Q8WVE6 324 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ZG16BQ96DA0 208 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF597Q96LX8 424 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 WDR92Q96MX6 357 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 AMDHD1Q96NU7 426 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 AMNQ9BXJ7 453 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 RAB9BQ9NP90 201 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 INIPQ9NRY2 104 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 CLN8Q9UBY8 286 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 NUP50Q9UKX7 468 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 VWA7Q9Y334 891 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 KIAA0232Q92628 1395 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 OR6C68A6NDL8 312 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 CENPXA8MT69 81 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF487B1APH4 448 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 E9PAM4 449 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 SNAI2O43623 268 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 LDB2O43679 373 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 LYPLA2O95372 231 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 PLEKHA8P1O95397 391 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 BAG3O95817 575 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 FGGP02679 453 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 GCP02774 474 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINB2P05120 415 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 GP1BAP07359 652 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TFPTP0C1Z6 253 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 GYPEP15421 78 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 PNLIPP16233 465 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ZP3P21754 424 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ASPAP45381 313 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 GYG1P46976 350 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 RASSF2P50749 326 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 RAP2BP61225 183 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 E2F1Q01094 437 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TNFRSF9Q07011 255 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 SREBF2Q12772 1141 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TRAM2Q15035 370 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 LINGO4Q6UY18 593 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 Q6ZUG5 572 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 FAM214BQ7L5A3 538 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 DYMQ7RTS9 669 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM17Q86X19 198 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM123Q8N131 208 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 PELI3Q8N2H9 469 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 Q8N402 240 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ALLCQ8N6M5 410 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 TM9SF4Q92544 642 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 SGTBQ96EQ0 304 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 VSTM2LQ96N03 204 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 GPR137Q96N19 417 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF570Q96NI8 536 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms