RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496325.5

PRKCZ-222, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 4

Gene PRKCZ, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-222	ENST00000496325	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CACNA1C	Q13936	2221 aa		14.51	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A1W2PRB8	838 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	C2orf72	A6NCS6	295 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACOT7	O00154	380 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ANKRD28	O15084	1053 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	IFI6	P09912	130 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	EPHA3	P29320	983 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CA7	P43166	264 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRKAG1	P54619	331 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	C21orf58	P58505	322 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	KRTAP10-9	P60411	292 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	RBPJ	Q06330	500 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GAB1	Q13480	694 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	MLC1	Q15049	377 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAVS	Q7Z434	540 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	NUP43	Q8NFH3	380 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	RELT	Q969Z4	430 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GIMAP5	Q96F15	307 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ADO	Q96SZ5	270 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	EQTN	Q9NQ60	294 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	NTM	Q9P121	344 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TINAG	Q9UJW2	476 aa		14.5	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	DNHD1	Q96M86	4753 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF195	O14628	629 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	EMC8	O43402	210 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	C6orf47	O95873	294 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	MAP3K8	P41279	467 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PER3	P56645	1201 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	WNT3	P56703	355 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PPP2R2A	P63151	447 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PGS1	Q32NB8	556 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	OGFOD2	Q6N063	350 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC35A4	Q96G79	324 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	COL21A1	Q96P44	957 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	DUSP26	Q9BV47	211 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	DPY30	Q9C005	99 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		14.49	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325		A0A1B0GUH1	482 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GNB5	O14775	395 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ICOSLG	O75144	302 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	IGHG3	P01860	377 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ACP2	P11117	423 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CYP4B1	P13584	511 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ABO	P16442	354 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	GABRA3	P34903	492 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PNLIPRP2	P54317	469 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PHC1	P78364	1004 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SLC10A1	Q14973	349 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM198	Q66K66	360 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	SZRD1	Q7Z422	152 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	FBXO30	Q8TB52	745 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		14.48	□□□□□ -0.09
PRKCZ-222	ENST00000496325	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		14.48	□□□□□ -0.09

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