RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494422.1

BRD9-211, Transcript of bromodomain containing 9, humanhuman

TSL 3

Gene BRD9, Length 449 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD9-211ENST00000494422 DNAJB5O75953 348 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 IL33O95760 270 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 NGFRP08138 427 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CT45A8P0DMV1 189 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CT45A9P0DMV2 189 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CAPN3P20807 821 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 MATN1P21941 496 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 IL12BP29460 328 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SOAT1P35610 550 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PIGAP37287 484 aa5.9□□□□□ -1.46
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BRD9-211ENST00000494422 CDK9P50750 372 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 DGKQP52824 942 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PRKAG1P54619 331 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 NME5P56597 212 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ARG2P78540 354 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PSG6Q00889 435 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 KRT72Q14CN4 511 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
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BRD9-211ENST00000494422 NTRK2Q16620 822 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ZSWIM7Q19AV6 140 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PRSS53Q2L4Q9 553 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SPATS1Q496A3 300 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 TM4SF20Q53R12 229 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CT45A2Q5DJT8 189 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 MFSD12Q6NUT3 480 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 RTL4Q6ZR62 310 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 Q6ZS92 163 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ASB18Q6ZVZ8 466 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 C6orf120Q7Z4R8 191 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 MISPQ8IVT2 679 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SLC30A8Q8IWU4 369 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SHISA5Q8N114 240 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 BEST3Q8N1M1 668 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 KIF2BQ8N4N8 673 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ZNF527Q8NB42 609 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 POGLUT1Q8NBL1 392 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 OR8J3Q8NGG0 315 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 OR9I1Q8NGQ6 314 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ZFP90Q8TF47 636 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 DIO2Q92813 273 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SLC35A4Q96G79 324 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SLC35G5Q96KT7 338 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 C5orf34Q96MH7 638 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 GAL3ST4Q96RP7 486 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 BTBD2Q9BX70 525 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ITPAQ9BY32 194 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 TPT1P8Q9HAU6 139 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SLC52A3Q9NQ40 469 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 SERHLQ9NQF3 203 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 LRFN1Q9P244 771 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ANAPC2Q9UJX6 822 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ABCG2Q9UNQ0 655 aa5.9□□□□□ -1.46
BRD9-211ENST00000494422 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.9□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa5.9□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 IGF2RP11717 2491 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 TMEM200CA6NKL6 621 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 HRKO00198 91 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 CLIC1O00299 241 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 MRASO14807 208 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 PPM1BO75688 479 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 OR2J2O76002 312 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SNX4O95219 450 aa5.89□□□□□ -1.47
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BRD9-211ENST00000494422 GPX2P18283 190 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 ATP6V1C1P21283 382 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 CALB2P22676 271 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 ABCD3P28288 659 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 GABRA3P34903 492 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 SOX18P35713 384 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 TNFSF10P50591 281 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 HPCAP84074 193 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 RBBP4Q09028 425 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 PLCXD2Q0VAA5 305 aa5.89□□□□□ -1.47
BRD9-211ENST00000494422 KLRB1Q12918 225 aa5.89□□□□□ -1.47
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