RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 LRIT2A6NDA9 550 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CLDN25C9JDP6 229 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 M0R3G1 203 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NR2F1P10589 423 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 IFI30P13284 250 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HOXB2P14652 356 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GRK3P35626 688 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RABIFP47224 123 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.367e-8■■■■■ 31.4
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HERC4-211ENST00000492996 SOX8P57073 446 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLAMF1Q13291 335 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF846Q147U1 533 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GPR19Q15760 415 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 C18orf63Q68DL7 685 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ENPP7Q6UWV6 458 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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HERC4-211ENST00000492996 SLC22A16Q86VW1 577 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FRMD1Q8N878 549 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PDXPQ96GD0 296 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 QRFPRQ96P65 431 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF347Q96SE7 839 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MROQ9BYG7 248 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GLIPR2Q9H4G4 154 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 EPS8L2Q9H6S3 715 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TAS2R16Q9NYV7 291 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TEKT2Q9UIF3 430 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ICKQ9UPZ9 632 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HMGN4O00479 90 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FFAR1O14842 300 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CCNB2O95067 398 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GASTP01350 101 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 STSP08842 583 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HSMCR30P0CW71 290 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ANXA8P13928 327 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ITGA2P17301 1181 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CERS1P27544 350 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 HSD17B2P37059 387 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 XCR1P46094 333 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ADPRHP54922 357 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 B2MP61769 119 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CTF1Q16619 201 aa6.58□□□□□ -1.36
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HERC4-211ENST00000492996 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR4C15Q8NGM1 316 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NEURL3Q96EH8 262 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR51I1Q9H343 314 aa6.58□□□□□ -1.36
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HERC4-211ENST00000492996 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa6.58□□□□□ -1.36
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HERC4-211ENST00000492996 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR10H3O60404 316 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CLPXO76031 633 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CD36P16671 472 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 JUNDP17535 347 aa6.58□□□□□ -1.36
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HERC4-211ENST00000492996 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RPE65Q16518 533 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 TPRG1LQ5T0D9 272 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SAXO2Q658L1 398 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF605Q86T29 641 aa6.58□□□□□ -1.36
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HERC4-211ENST00000492996 LACC1Q8IV20 430 aa6.58□□□□□ -1.36
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HERC4-211ENST00000492996 OR4D11Q8NGI4 311 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 LCN9Q8WX39 176 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC4-211ENST00000492996 ZNF566Q969W8 418 aa6.58□□□□□ -1.36
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