RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 UNC50Q53HI1 259 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 MILR1Q7Z6M3 343 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 IFNEQ86WN2 208 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CCDC63Q8NA47 563 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ADCY4Q8NFM4 1077 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 KLHL29Q96CT2 875 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 C18orf12Q96KH6 178 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ACBD3Q9H3P7 528 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 PIGMQ9H3S5 423 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 BRF2Q9HAW0 419 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 NEUROD4Q9HD90 331 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 PRODH2Q9UF12 536 aa18.06■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 OR6C70A6NIJ9 312 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SPAG7O75391 227 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SUPT7LO94864 414 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 OTCP00480 354 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 PDYNP01213 254 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CPA3P15088 417 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CHMP24386 653 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SRD5A2P31213 254 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CPA2P48052 419 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 HMGCS1Q01581 520 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SRYQ05066 204 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CLCQ05315 142 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CASP8Q14790 479 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 LTB4RQ15722 352 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SGO1Q5FBB7 561 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SCIMPQ6UWF3 145 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 PLXDC2Q6UX71 529 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 PLCZ1Q86YW0 608 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TMCO6Q96DC7 493 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SLC35A4Q96G79 324 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SMR3AQ99954 134 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 PSME2Q9UL46 239 aa18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 A8MXE2 369 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 HCRTR2O43614 444 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TYROBPO43914 113 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CREB1P16220 341 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 PCSK2P16519 638 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ZNF708P17019 499 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 STARP49675 285 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CDH13P55290 713 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CLDN18P56856 261 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 DNAJB13P59910 316 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 NAA20P61599 178 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 LTBQ06643 244 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 GAB1Q13480 694 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ZNF628Q5EBL2 1059 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 FAM180BQ6P0A1 224 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 LETMD1Q6P1Q0 360 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 GCNT2Q8N0V5 402 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ZNF675Q8TD23 568 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TCP10LQ8TDR4 215 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 RNF138Q8WVD3 245 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SELENOMQ8WWX9 145 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TMBIM1Q969X1 311 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 COL21A1Q96P44 957 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 BTBD9Q96Q07 612 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 CENPHQ9H3R5 247 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 OXSMQ9NWU1 459 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TAS2R10Q9NYW0 307 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 FBXL2Q9UKC9 423 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 STK38LQ9Y2H1 464 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 WIF1Q9Y5W5 379 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ACTL7BQ9Y614 415 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 PLOD2O00469 737 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 PPP6CO00743 305 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ABCB7O75027 752 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TNFSF13O75888 250 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 MYZAPP0CAP1 466 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 AAGABQ6PD74 315 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 EXOC3L1Q86VI1 746 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 FAM111AQ96PZ2 611 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ZNF382Q96SR6 550 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 FAIM2Q9BWQ8 316 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 GSTO2Q9H4Y5 243 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SLC17A7Q9P2U7 560 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 HEY2Q9UBP5 337 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ZNF225Q9UK10 706 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 PACSIN3Q9UKS6 424 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 SNX6Q9UNH7 406 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 TESMINQ9Y4I5 508 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-212ENST00000492539 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms