RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 HPF1Q9NWY4 346 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1W2PRQ8 180 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ACOD1A6NK06 481 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 YY2O15391 372 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ECDO95905 644 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ITGAMP11215 1152 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ACVR2AP27037 513 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PUDPQ08623 228 aa11.67□□□□□ -0.54
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TRIOBP-211ENST00000492485 TAF13Q15543 124 aa11.67□□□□□ -0.54
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TRIOBP-211ENST00000492485 NUP43Q8NFH3 380 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 OR52E2Q8NGJ4 325 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 HSPA12BQ96MM6 686 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 CTRCQ99895 268 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 KXD1Q9BQD3 176 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SPATA9Q9BWV2 254 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 HOXD1Q9GZZ0 328 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TRIM36Q9NQ86 728 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 CA5BQ9Y2D0 317 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 QSOX1O00391 747 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 HIST1H2ABP04908 130 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ANXA3P12429 323 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 CTSEP14091 401 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 AK4P27144 223 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ERP29P30040 261 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 GBX1Q14549 363 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 C18orf63Q68DL7 685 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TM9SF4Q92544 642 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 IRF7Q92985 503 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 HIST1H2ACQ93077 130 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 C3orf49Q96BT1 292 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF354BQ96LW1 612 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 COQ10AQ96MF6 247 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 OR4K3Q96R72 315 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1W2PP55 124 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 AGPAT2O15120 278 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 GPR37L1O60883 481 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 EFCAB14O75071 495 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 CSF2RAP15509 400 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 UQCRC2P22695 453 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PFN3P60673 137 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 GPLD1P80108 840 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 RGS1Q08116 209 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 GAS6Q14393 721 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TOMM20Q15388 145 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 GALNT11Q8NCW6 608 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ACOT12Q8WYK0 555 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC7A6Q92536 515 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 FKBP10Q96AY3 582 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC46A2Q9BY10 475 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SRMSQ9H3Y6 488 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF226Q9NYT6 803 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 FNIP2Q9P278 1114 aa11.67□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 STRCP1A6NGW2 1772 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 C5orf51A6NDU8 294 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 KHKP50053 298 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 KIAA1024LP59773 190 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 BTN2A1Q7KYR7 527 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC44A3Q8N4M1 653 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 BBS1Q8NFJ9 593 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 UCN3Q969E3 161 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TRIB3Q96RU7 358 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC6A15Q9H2J7 730 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MLXQ9UH92 298 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 SLC7A7Q9UM01 511 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 PPP1R3DO95685 299 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 HOXA9P31269 272 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 GABRA3P34903 492 aa11.66□□□□□ -0.54
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TRIOBP-211ENST00000492485 OR10A3P58181 314 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 KCNJ10P78508 379 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 OR7G1Q8NGA0 311 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 WDR26Q9H7D7 661 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 MYOFQ9NZM1 2061 aa11.66□□□□□ -0.54
TRIOBP-211ENST00000492485 TVP23AA6NH52 213 aa11.66□□□□□ -0.54
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