RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 Q9N2J8 555 aa8.37□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.37□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.37□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.37□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 NTMQ9P121 344 aa8.37□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 CBLCQ9ULV8 474 aa8.37□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 GXYLT2A0PJZ3 443 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 PRAMEF25A6NGN4 478 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 TTC36A6NLP5 189 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SNPHO15079 494 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 EMC8O43402 210 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 IL33O95760 270 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 HPNP05981 417 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 KITP10721 976 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 CYP4B1P13584 511 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 PTPN6P29350 595 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 MAP3K8P41279 467 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 TRPC1P48995 793 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SMSP52788 366 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 DIO3P55073 304 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 C21orf58P58505 322 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 TOMM20Q15388 145 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 DECR1Q16698 335 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 PGS1Q32NB8 556 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 WLSQ5T9L3 541 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 TMEM211Q6ICI0 200 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 XKRXQ6PP77 449 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 RPTNQ6XPR3 784 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 HDXQ7Z353 690 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SZRD1Q7Z422 152 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 LRRC34Q8IZ02 419 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 CDRT4Q8N9R6 151 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 RNF138Q8WVD3 245 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 PIK3R3Q92569 461 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 GIMAP5Q96F15 307 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 DUSP26Q9BV47 211 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 DPY30Q9C005 99 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 EQTNQ9NQ60 294 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SPRR3Q9UBC9 169 aa8.36□□□□□ -1.07
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SYN3-211ENST00000472027 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.36□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SLCO1B7G3V0H7 640 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SDHDO14521 159 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 KLF11O14901 512 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 HDAC3O15379 428 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 CFLARO15519 480 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 CBR3O75828 277 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 NKX2-2O95096 273 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 KCNH1O95259 989 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 C6orf47O95873 294 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ACP2P11117 423 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 AGAP20933 346 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 RFX3P48380 749 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 CCT3P49368 545 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 PRIM2P49643 509 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 GAS1P54826 345 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 PRR5P85299 388 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 OCRLQ01968 901 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 ART3Q13508 389 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 VPS26BQ4G0F5 336 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 EIPR1Q53HC9 387 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 TTMPQ5BVD1 217 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 OR4F3Q6IEY1 312 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 MFSD12Q6NUT3 480 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 CAMKMTQ7Z624 323 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.35□□□□□ -1.07
SYN3-211ENST00000472027 SLC16A11Q8NCK7 471 aa8.35□□□□□ -1.07
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