RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 RAET1EQ8TD07 263 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 NPRL2Q8WTW4 380 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 RLN3Q8WXF3 142 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ART4Q93070 314 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SENP8Q96LD8 212 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ESM1Q9NQ30 184 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 OR10H1Q9Y4A9 318 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CPQQ9Y646 472 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF16BQ96L93 1317 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 TM9SF1O15321 606 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 KIAA0754O94854 1291 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 OPN1MWP04001 364 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 UGT2B4P06133 528 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 HCKP08631 526 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ANXA3P12429 323 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 LMO2P25791 158 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 OXTRP30559 389 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CAPGP40121 348 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 MFAP2P55001 183 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CNTN2Q02246 1040 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC152Q4G0S7 254 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CEP55Q53EZ4 464 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ACER2Q5QJU3 275 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 BTNL3Q6UXE8 466 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 DPY19L4Q7Z388 723 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ANKRD37Q7Z713 158 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF329Q86UD4 541 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 PHC2Q8IXK0 858 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2T3Q8NH03 318 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 WBP1Q96G27 269 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC30A2Q9BRI3 323 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 TRIM51Q9BSJ1 452 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 FEM1AQ9BSK4 669 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SYT11Q9BT88 431 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC25A51Q9H1U9 297 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 TUBB1Q9H4B7 451 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 GORASP2Q9H8Y8 452 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 ADGRL4Q9HBW9 690 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 GALPQ9UBC7 116 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGGTB-207ENST00000470201 FER1L5A0AVI2 2057 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 GRIN2DO15399 1336 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 A8MXK9 166 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 DUX1O43812 170 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 MTX2O75431 263 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 MT-ND1P03886 318 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 OPN1LWP04000 364 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 RGS4P49798 205 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 EMDP50402 254 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 METAP1P53582 386 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 HILS1P60008 231 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 CBX1P83916 185 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 ACY1Q03154 408 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 SELPLGQ14242 412 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB35Q15286 201 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 UBE2V2Q15819 145 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 PCK2Q16822 640 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 KLHL22Q53GT1 634 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 RABGAP1LQ5R372 815 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 SEL1L2Q5TEA6 688 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 REP15Q6BDI9 236 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 CENPPQ6IPU0 288 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 CEACAM19Q7Z692 300 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 SPEM1Q8N4L4 309 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 NANPQ8TBE9 248 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 MIPOL1Q8TD10 442 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 SHC3Q92529 594 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 TADA1Q96BN2 335 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 NTNG2Q96CW9 530 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 MOCOSQ96EN8 888 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 AGAP3Q96P47 875 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 TTYH2Q9BSA4 534 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC28BQ9BUN5 200 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGGTB-207ENST00000470201 NFKBIZQ9BYH8 718 aa3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms