RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 NCS1P62166 190 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 PLAG1Q6DJT9 500 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 SLCO6A1Q86UG4 719 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 SHISA5Q8N114 240 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 DEFB119Q8N690 84 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 AVL9Q8NBF6 648 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 DOK4Q8TEW6 326 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 LGALS12Q96DT0 336 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 SDF2Q99470 211 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa16.03■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 SCN2AQ99250 2005 aa16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 RDH16O75452 317 aa16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CSF2P04141 144 aa16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 DGUOKQ16854 277 aa16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF730Q6ZMV8 503 aa16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF367Q7RTV3 350 aa16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 IQCF1Q8N6M8 205 aa16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 TCEANCQ8N8B7 351 aa16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 CDRT4Q8N9R6 151 aa16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 GPA33Q99795 319 aa16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 TBC1D23Q9NUY8 699 aa16.02■□□□□ 0.16
FAAP20-211ENST00000469733 FAM170BA6NMN3 283 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 EFCAB9A8MZ26 197 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 WNT1P04628 370 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 IFI6P09912 130 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 NME1P15531 152 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 CD38P28907 300 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 SERPINB10P48595 397 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 C21orf59P57076 290 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 GINS1Q14691 196 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 UBXN2BQ14CS0 331 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 EIPR1Q53HC9 387 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 CCNJQ5T5M9 372 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF836Q6ZNA1 936 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 RRM2BQ7LG56 351 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 OR9A4Q8NGU2 314 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 MCHR1Q99705 422 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF350Q9GZX5 532 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 DUSP22Q9NRW4 184 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 TVP23BQ9NYZ1 205 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 MAT2BQ9NZL9 334 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 DOLKQ9UPQ8 538 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 SATB2Q9UPW6 733 aa16.02■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM265A0A087WTH1 108 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 METTL12A8MUP2 240 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 AIREO43918 545 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 THBS1P07996 1170 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 GIPRP48546 466 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 HOXC5Q00444 222 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 DUSP8Q13202 625 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 DCST2Q5T1A1 773 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 MEDAGQ5VYS4 303 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 GKN2Q86XP6 184 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF619Q8N2I2 560 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 ARL14Q8N4G2 192 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 COX18Q8N8Q8 333 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 STACQ99469 402 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 TAS2R16Q9NYV7 291 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 AGAP5A6NIR3 686 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 STX11O75558 287 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 NADKO95544 446 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 FASLGP48023 281 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 PCYT1AP49585 367 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 SMSP52788 366 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 CDK5Q00535 292 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 MGAT2Q10469 447 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 GPR68Q15743 365 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 OCLNQ16625 522 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 ARMCX4Q5H9R4 360 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 MFSD4BQ5TF39 518 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 PIGXQ8TBF5 258 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 LMX1AQ8TE12 382 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa16.01■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 A0A1W2PR77 199 aa16■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 KRBA1A5PL33 1030 aa16■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 CHST10O43529 356 aa16■□□□□ 0.15
FAAP20-211ENST00000469733 OR5F1O95221 314 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms