RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428082.6

TVP23C-203, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-203ENST00000428082 LILRA5A6NI73 299 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 FFAR1O14842 300 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 UGT2B17O75795 530 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 HSMCR30P0CW71 290 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 CSNK1G2P78368 415 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 IFITM3Q01628 133 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 TP53BP2Q13625 1128 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 C12orf73Q69YU5 71 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 TCTN3Q6NUS6 607 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 SFXN5Q8TD22 340 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 U3KQA8 63 aa14.71□□□□□ -0.05
TVP23C-203ENST00000428082 ASXL3Q9C0F0 2248 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.71□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 A0A0A6YYD5 115 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 FEZF1A0PJY2 475 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 GSAPA4D1B5 854 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 UBXN7O94888 489 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 GLB1P16278 677 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 NBL1P41271 181 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 SSR2P43308 183 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 XKP51811 444 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 LIMK1P53667 647 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 CRISP3P54108 245 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 RPS26P62854 115 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 ABATP80404 500 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 CBX3Q13185 183 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 MED22Q15528 200 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 CD300LDQ6UXZ3 194 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 DEF8Q6ZN54 512 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 ITFG2Q969R8 447 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 TMEM80Q96HE8 168 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 OR2A14Q96R47 310 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 BCL2L10Q9HD36 194 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 RP1P56715 2156 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 A0A1W2PRQ8 180 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 OR5K3A6NET4 321 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 DLL1O00548 723 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 TMPRSS11DO60235 418 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 SNX4O95219 450 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 ZNF883P0CG24 379 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 NR2F1P10589 423 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 UGT2B7P16662 529 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 PPP1CAP62136 330 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 SLC9A5Q14940 896 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 KIR2DS3Q14952 304 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 OCLNQ16625 522 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 ADCK2Q7Z695 626 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 OOSP2Q86WS3 158 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 OR2L3Q8NG85 312 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 PIK3R3Q92569 461 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 RAB8BQ92930 207 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 OR51E2Q9H255 320 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 LHX9Q9NQ69 397 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 SEMA4GQ9NTN9 838 aa14.7□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 IRGMA1A4Y4 181 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 H3BN98 237 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 SCG5P05408 212 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 GSTM3P21266 225 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 ETV6P41212 452 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 OR1D5P58170 312 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 NR0B2Q15466 257 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 SLC25A30Q5SVS4 291 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 TRIM73Q86UV7 250 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 AMDHD1Q96NU7 426 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 BBS4Q96RK4 519 aa14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TVP23C-203ENST00000428082 DPH7Q9BTV6 452 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms