RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 RASAL1O95294 804 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HPRP00739 348 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 IGKV3-11P04433 115 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ACP2P11117 423 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CCL4P13236 92 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ICAM2P13598 275 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CEACAM1P13688 526 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 IL7RP16871 459 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 NAGAP17050 411 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CD82P27701 267 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC5A2P31639 672 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PIGAP37287 484 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RPS6KA3P51812 740 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC37A1P57057 533 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PSG6Q00889 435 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CHRNEQ04844 493 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MAPK11Q15759 364 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DUSP5Q16690 384 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DECR1Q16698 335 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DUSP7Q16829 419 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DCST2Q5T1A1 773 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 WLSQ5T9L3 541 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MLIPQ5VWP3 458 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LPCAT4Q643R3 524 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC29A4Q7RTT9 530 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OR52P1PQ8NH57 321 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF721Q8TF20 911 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CDS1Q92903 461 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LPAR4Q99677 370 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GPR87Q9BY21 358 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ULBP3Q9BZM4 244 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 REEP1Q9H902 201 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 APMAPQ9HDC9 416 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CBLCQ9ULV8 474 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ERVK-19Q9WJR5 959 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ENPP4Q9Y6X5 453 aa8.93□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 MUC3AQ02505 3323 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 KIF26BQ2KJY2 2108 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FRG2CA6NGY1 282 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TPST1O60507 370 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 E2F6O75461 281 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 KCNK2O95069 426 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TIAF1O95411 115 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 DDAH2O95865 285 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CHRM4P08173 479 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CT45A8P0DMV1 189 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CT45A9P0DMV2 189 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 THRBP10828 461 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ANXA8P13928 327 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF23P17027 643 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CD247P20963 164 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FPR1P21462 350 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 AQP1P29972 269 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ADH7P40394 386 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 GPR143P51810 404 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PGDP52209 483 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 PDX1P52945 283 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CRYBA2P53672 197 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ATP12AP54707 1039 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 SSPNQ14714 243 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF141Q15928 474 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 IQCCQ4KMZ1 466 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LIN52Q52LA3 116 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 FRRS1Q6ZNA5 592 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD37Q7Z713 158 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.92□□□□□ -0.98
HDLBP-211ENST00000425989 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms