RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 PTGDSP41222 190 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 RFX3P48380 749 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 OCRLQ01968 901 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 FNDC7Q5VTL7 733 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CD163Q86VB7 1156 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO30Q8TB52 745 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM57AQ8TBR7 257 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC35A4Q96G79 324 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC120Q96HB5 630 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PHF12Q96QT6 1004 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 DUSP26Q9BV47 211 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 OSBPL11Q9BXB4 747 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 DPY30Q9C005 99 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 Q9N2J8 555 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CBLCQ9ULV8 474 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PCNX1Q96RV3 2341 aa22.88■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 GXYLT2A0PJZ3 443 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ABCB7O75027 752 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 C6orf47O95873 294 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 IGHG3P01860 377 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 IFI6P09912 130 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 TRPC1P48995 793 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 MAN2A2P49641 1150 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PNLIPRP2P54317 469 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 EFR3AQ14156 821 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 MLC1Q15049 377 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 TOMM20Q15388 145 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP27C1Q4G0S4 372 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC30A6Q6NXT4 461 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 GPR151Q8TDV0 419 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 OR5P2Q8WZ92 322 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PIK3R3Q92569 461 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC9A6Q92581 669 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 C16orf58Q96GQ5 468 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM41AQ96HV5 264 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 YIPF4Q9BSR8 244 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC6A15Q9H2J7 730 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 HRH3Q9Y5N1 445 aa22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 TRPC5OSA6NMA1 111 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CFLARO15519 480 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP4B1P13584 511 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 EPHA3P29320 983 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 NME5P56597 212 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PSPHP78330 225 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 DECR1Q16698 335 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 TIGD3Q6B0B8 471 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 OR5M9Q8NGP3 310 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 OR1J4Q8NGS1 313 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 NTNG2Q96CW9 530 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 GIMAP5Q96F15 307 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 NTMQ9P121 344 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 MEMO1Q9Y316 297 aa22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SASH3O75995 380 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 C21orf58P58505 322 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SNTA1Q13424 505 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SPDYE7PQ495Y7 208 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 NXNQ6DKJ4 435 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 OR4F3Q6IEY1 312 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 TMEM81Q6P7N7 255 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 NATD1Q8N6N6 113 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 MS4A4EQ96PG1 132 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CXorf36Q9H7Y0 433 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ACAD8Q9UKU7 415 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 MAPRE3Q9UPY8 281 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 C15orf41Q9Y2V0 281 aa22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A1B0GVC2 190 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SLCO1B7G3V0H7 640 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 KLF11O14901 512 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SUSD5O60279 629 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CLDN1O95832 211 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 ACP2P11117 423 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CCT3P49368 545 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PRR5P85299 388 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 GXYLT1Q4G148 440 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 GALNT10Q86SR1 603 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CDRT4Q8N9R6 151 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC16A11Q8NCK7 471 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 SERHLQ9NQF3 203 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 PNPLA3Q9NST1 481 aa22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1-202ENST00000425695 QPCTLQ9NXS2 382 aa22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms