RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D17Q9HA65 648 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNK12Q9HB15 430 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CLCA2Q9UQC9 943 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PRQ8 180 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 LILRB5O75023 590 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 RAF1P04049 648 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TPOP07202 933 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ELK1P19419 428 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CNTN1Q12860 1018 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TEAD2Q15562 447 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC36A4Q6YBV0 504 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 NEIL3Q8TAT5 605 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 XAGE5Q8WWM1 108 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SMPDL3AQ92484 453 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 C17orf62Q9BQA9 187 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM106CQ9BVX2 250 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 NEUROD4Q9HD90 331 aa17.23■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 I3L521 148 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MOSPD3O75425 235 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PAHP00439 452 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 GAAP10253 952 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF250P15622 560 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SYN1P17600 705 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MTNR1AP48039 350 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SMSP52788 366 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 METAP1P53582 386 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 NTHL1P78549 312 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 INSL4Q14641 139 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 NDUFA9Q16795 377 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 BCL2L15Q5TBC7 163 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PXDC1Q5TGL8 231 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 LHFPL3Q86UP9 236 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM129CQ86XR2 697 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD53Q8N9V6 530 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 OR6T1Q8NGN1 323 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR14Q9BWN1 585 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 EMC7Q9NPA0 242 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 EXTL2Q9UBQ6 330 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 IL36AQ9UHA7 158 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 GABRPO00591 440 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 LANCL1O43813 399 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MYOGP15173 224 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PTGER1P34995 402 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CCT3P49368 545 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MINDY4Q4G0A6 757 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF805Q5CZA5 627 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF697Q5TEC3 545 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF18BQ86Y91 864 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D19Q8N5T2 526 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 OR11H7Q8NGC8 314 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SPPL3Q8TCT6 385 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE2E3Q969T4 207 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 OTULINQ96BN8 352 aa17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 EPPINO95925 133 aa17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CFL1P23528 166 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 BSGP35613 385 aa17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ASB18Q6ZVZ8 466 aa17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF547Q8IVP9 402 aa17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 OR11H4Q8NGC9 324 aa17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 CHFRQ96EP1 664 aa17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 MRGPRX3Q96LB0 322 aa17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF222Q9UK12 451 aa17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 PRKAB1Q9Y478 270 aa17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 UNC80Q8N2C7 3258 aa17.21■□□□□ 0.35
RALGPS1-208ENST00000424082 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 FEZF1A0PJY2 475 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN11A1L157 253 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 SNTNA6NMZ2 147 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 HLA-DPB1P04440 258 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 EPCAMP16422 314 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC6A11P48066 632 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 CAMK1Q14012 370 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 POU4F3Q15319 338 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 WASH2PQ6VEQ5 465 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 MORN4Q8NDC4 146 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 OR5AR1Q8NGP9 310 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 OR51I1Q9H343 314 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 AHSPQ9NZD4 102 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 TRPC4Q9UBN4 977 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 ASF1AQ9Y294 204 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 IRAK3Q9Y616 596 aa17.21■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 REV3LO60673 3130 aa17.2■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 CIB4A0PJX0 185 aa17.2■□□□□ 0.34
RALGPS1-208ENST00000424082 CD8B2A6NJW9 211 aa17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms