RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZIC3O60481 467 aa11.89□□□□□ -0.51
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CT45A9P0DMV2 189 aa11.89□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEPDP12955 493 aa11.89□□□□□ -0.51
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC39A3Q9BRY0 314 aa11.88□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GSX2Q9BZM3 304 aa11.88□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSS3Q9H6R3 686 aa11.88□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOLH1BQ9HBA9 442 aa11.88□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCM8Q9UJA3 840 aa11.88□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INAFM1C9JVW0 142 aa11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C16orf97H3BN30 126 aa11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMC8O43402 210 aa11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCO2O43819 266 aa11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CGAP01215 116 aa11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL3P08700 152 aa11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD8BP10966 210 aa11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN8P19075 237 aa11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HK1P19367 917 aa11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHBP35232 272 aa11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ5P48544 419 aa11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH13P55290 713 aa11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP2R2BQ00005 443 aa11.87□□□□□ -0.51
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