RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 RAB42Q8N4Z0 105 aa12.4□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PROKR2Q8NFJ6 384 aa12.4□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 LRR1Q96L50 414 aa12.4□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 C12orf66Q96MD2 445 aa12.4□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa12.4□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa12.4□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 ACAD8Q9UKU7 415 aa12.4□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 HCN2Q9UL51 889 aa12.4□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 OR1A2Q9Y585 309 aa12.4□□□□□ -0.42
TMOD1-202ENST00000375175 LATO43561 262 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 FGBP02675 491 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 NTSP30990 170 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 RAB25P57735 213 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 KRT33BQ14525 404 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SNAPC1Q16533 368 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 OCLNQ16625 522 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 WSCD2Q2TBF2 565 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SPRED2Q7Z698 418 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 LINC01555Q8NAE3 123 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 GALNT11Q8NCW6 608 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 OR6T1Q8NGN1 323 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 CREB3L4Q8TEY5 395 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM203Q969S6 136 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SLC25A46Q96AG3 418 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 MENTQ9BUN1 341 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 FAIM2Q9BWQ8 316 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 KLHL31Q9H511 634 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 NT5DC2Q9H857 520 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 IL23AQ9NPF7 189 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 MALT1Q9UDY8 824 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 MYO10Q9HD67 2058 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 A0A1W2PRQ8 180 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 APOL3O95236 402 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 TP53P04637 393 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ACP5P13686 325 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 APEX1P27695 318 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 GIPRP48546 466 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 PER3P56645 1201 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 HTRA3P83110 453 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 MFSD13AQ14CX5 517 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 POU4F3Q15319 338 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ACSM5Q6NUN0 579 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 FAM122CQ6P4D5 195 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 TIGD4Q8IY51 512 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 OR52I1Q8NGK6 324 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 RACGAP1Q9H0H5 632 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ADAM29Q9UKF5 820 aa12.39□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 A0A0A6YYD5 115 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 LRIT2A6NDA9 550 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 TSPAN4O14817 238 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 RAB36O95755 333 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 C8orf89P0DMQ9 161 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ICAM2P13598 275 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 DRD2P14416 443 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ARSBP15848 533 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 KHKP50053 298 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 COX10Q12887 443 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SLC9A5Q14940 896 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF750Q32MQ0 723 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 FLYWCH1Q4VC44 716 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SYT14P1Q58G82 188 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF793Q6ZN11 406 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 CDH24Q86UP0 819 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 PHC2Q8IXK0 858 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC116Q8IYX3 515 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 FAM26EQ8N5C1 309 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 FUZQ9BT04 418 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 PRR14Q9BWN1 585 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 C11orf49Q9H6J7 331 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 NDUFB11Q9NX14 153 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 AUP1Q9Y679 476 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 HYKKA2RU49 373 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 KIAA0355O15063 1070 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 PGRMC2O15173 223 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 PLOD3O60568 738 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 CLEC3AO75596 197 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 CHRM4P08173 479 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 MSL3P1P0C860 447 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ETV5P41161 510 aa12.38□□□□□ -0.43
TMOD1-202ENST00000375175 WASP42768 502 aa12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms