RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369439.4

TMLHE-202, Transcript of trimethyllysine hydroxylase, epsilon, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMLHE, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMLHE-202ENST00000369439 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 MED12Q93074 2177 aa4.37□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 ARID1AO14497 2285 aa4.37□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 TRBC2A0A5B9 178 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 RNF212BA8MTL3 300 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 C17orf105B2RV13 164 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 GFYI3L273 518 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 M0QYG6 137 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 CLGNO14967 610 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 WDR1O75083 606 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 TRAPPC6AO75865 159 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 ZFAND5O76080 213 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 GLSO94925 669 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 SBK3P0C264 359 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 NR2F1P10589 423 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 HIST1H2ADP20671 130 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 CNR1P21554 472 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 IL10P22301 178 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 HRH2P25021 359 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 GDF1P27539 372 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 STIP1P31948 543 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 GDNFP39905 211 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 NPY2RP49146 381 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 RGS4P49798 205 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF136P52737 540 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 CDKN2DP55273 166 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 SKP1P63208 163 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 REEP5Q00765 189 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 SRYQ05066 204 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 STX4Q12846 297 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 EPS8Q12929 822 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 GPS1Q13098 491 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 SLC10A1Q14973 349 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 RASA2Q15283 850 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 RPS6KA1Q15418 735 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 DCST1Q5T197 706 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 LCTLQ6UWM7 567 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 HSDL2Q6YN16 418 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 CAMKMTQ7Z624 323 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 CCDC170Q8IYT3 715 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 GCNT2Q8N0V5 402 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 TBC1D19Q8N5T2 526 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 NFKBIDQ8NI38 313 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 NT5CQ8TCD5 201 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 FAM222BQ8WU58 562 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 KCNJ9Q92806 393 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 PEX13Q92968 403 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 APOPT1Q96IL0 206 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 FAR2Q96K12 515 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 EGFL8Q99944 293 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 FUZQ9BT04 418 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 SGPP1Q9BX95 441 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 PCBD2Q9H0N5 130 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 SLC25A32Q9H2D1 315 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 TSPY26PQ9H489 355 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 PARVBQ9HBI1 364 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 B4GALT7Q9UBV7 327 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 GUCA1BQ9UMX6 200 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 DHRS7Q9Y394 339 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 ATG4BQ9Y4P1 393 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 NCKAP5O14513 1909 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 ZANQ9Y493 2812 aa4.36□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 OR14I1A6ND48 311 aa4.35□□□□□ -1.71
TMLHE-202ENST00000369439 FAM90A18PA6NE21 464 aa4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms