RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ENY2Q9NPA8 101 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LHX3Q9UBR4 397 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ACAD8Q9UKU7 415 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 C4AP0C0L4 1744 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TRIM64A6NGJ6 449 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PHYHO14832 338 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 VNN2O95498 520 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF28P17035 718 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SFTPDP35247 375 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CDKN2CP42773 168 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 POU3F4P49335 361 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZXDBP98169 803 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CDKN3Q16667 212 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PAGE3Q5JUK9 113 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LEG1Q6P5S2 330 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NXPE3Q969Y0 559 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LGALS12Q96DT0 336 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GSKIPQ9P0R6 139 aa9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CER1O95813 267 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PVRP15151 417 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 UGT2B10P36537 528 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MAGEA2P43356 314 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TMBIM6P55061 237 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MAB21L1Q13394 359 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PLBD1Q6P4A8 553 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 KCTD9Q7L273 389 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PPP1R3BQ86XI6 285 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF584Q8IVC4 421 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 POT1Q9NUX5 634 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 H3BML4 177 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC19A2O60779 497 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 C1orf105O95561 183 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PLATP00750 562 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PNMTP11086 282 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OSMP13725 252 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TNFRSF1BP20333 461 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GRPRP30550 384 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 HLCSP50747 726 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PRPS1P60891 318 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NKX3-2P78367 333 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF45Q02386 682 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NR0B2Q15466 257 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM69Q5SWH9 247 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC18B1Q6NT16 456 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SLC22A16Q86VW1 577 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LAS2Q8IYD9 372 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 OR8S1Q8NH09 359 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NETO1Q8TDF5 533 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MACROD1Q9BQ69 325 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 KLHL21Q9UJP4 597 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 LINC01553A4QN01 128 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 M0R3H8 397 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF806P0C7X5 589 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CNR2P34972 360 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 MAP2K4P45985 399 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 IST1P53990 364 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PIGFQ07326 219 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GRK1Q15835 563 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 CHRFAM7AQ494W8 412 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 DTWD1Q8N5C7 304 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ZBP1Q9H171 429 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 ALG5Q9Y673 324 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 SH3D21A4FU49 640 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 H3BUI4 141 aa9.75□□□□□ -0.85
ZNF548-202ENST00000366197 GFRA2O00451 464 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms