RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362830.1

RNU6-223P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 223, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-223P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-223P-201ENST00000362830 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 LRIT2A6NDA9 550 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 H3BTX0 84 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 OR1F1O43749 312 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 PDE5AO76074 875 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 B3GAT3O94766 335 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 IGHV3-9P01782 118 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC35G4P0C7Q5 338 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 THRBP10828 461 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 CPN1P15169 458 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC1A4P43007 532 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 PTGER3P43115 390 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 ACADVLP49748 655 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 SRPXP78539 464 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 NUCB2P80303 420 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 MS4A18Q3C1V0 323 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 C2CD6Q53TS8 623 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF311Q5JNZ3 666 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 PRR5LQ6MZQ0 368 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 BTNL3Q6UXE8 466 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 P4HA3Q7Z4N8 544 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 CENPSQ8N2Z9 138 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 Q8N377 158 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 OR52M1Q8NGK5 317 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 OR52J3Q8NH60 311 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF606Q8WXB4 792 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 THRSPQ92748 146 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 HPDLQ96IR7 371 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 TTC25Q96NG3 672 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 AGAP3Q96P47 875 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 VPS35Q96QK1 796 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 IWS1Q96ST2 819 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 GPA33Q99795 319 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 TBCDQ9BTW9 1192 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 RIBC2Q9H4K1 309 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 MOB1AQ9H8S9 216 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 GNB4Q9HAV0 340 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 LPAR2Q9HBW0 351 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 ESM1Q9NQ30 184 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 C1orf123Q9NWV4 160 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 RARRES3Q9UL19 164 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 CHMP2BQ9UQN3 213 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 RNF212BA8MTL3 300 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 A8MXK9 166 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 H0YCG3 227 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 PDHXO00330 501 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 MAPK13O15264 365 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 CTAGE5O15320 804 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 TM9SF1O15321 606 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 DUX1O43812 170 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 TYROBPO43914 113 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 POP4O95707 220 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 IGF1P05019 195 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 MELTFP08582 738 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 TRIM49P0CI25 452 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 TRIM49CP0CI26 452 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 PRG2P13727 222 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 ATP6V1C1P21283 382 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 UQCRC2P22695 453 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 PSMA5P28066 241 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 NOVP48745 357 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 DSCR10P59022 87 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 CHIT1Q13231 466 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 LTB4RQ15722 352 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 CHI3L2Q15782 390 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC36A3Q495N2 470 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 CCDC152Q4G0S7 254 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 ACER2Q5QJU3 275 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 RABGAP1LQ5R372 815 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 FAM120AOSQ5T036 256 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 DDI2Q5TDH0 399 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 LEMD1Q68G75 181 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 DOK6Q6PKX4 331 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 VASH2Q86V25 355 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 PARGQ86W56 976 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 LINC01561Q8N1V8 128 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 ABHD12Q8N2K0 398 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 M1APQ8TC57 530 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 LRRC15Q8TF66 581 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 FAM222BQ8WU58 562 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC5A11Q8WWX8 675 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF597Q96LX8 424 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 FAM173AQ9BQD7 235 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 OCR1Q9BZK8 76 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-223P-201ENST00000362830 STRADBQ9C0K7 418 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms