RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356175.7

NF1-201, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NF1, Length 12,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-201ENST00000356175 MED16Q9Y2X0 877 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 DLC1Q96QB1 1528 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 ACOD1A6NK06 481 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 NME4O00746 187 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 FCER1GP30273 86 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 ARL2P36404 184 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 PIGZQ86VD9 579 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 MED18Q9BUE0 208 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 H7C417 338 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 GJA4P35212 333 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 LCP2Q13094 533 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 MON1BQ7L1V2 547 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 TNFSF4P23510 183 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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NF1-201ENST00000356175 HOXC5Q00444 222 aa6.5□□□□□ -1.37
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NF1-201ENST00000356175 OR5I1Q13606 314 aa6.5□□□□□ -1.37
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NF1-201ENST00000356175 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 ZNF676Q8N7Q3 588 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.5□□□□□ -1.37
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NF1-201ENST00000356175 SEC22AQ96IW7 307 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 FAM189A1O60320 539 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 SOX30O94993 753 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 KLRK1P26718 216 aa6.5□□□□□ -1.37
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NF1-201ENST00000356175 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.5□□□□□ -1.37
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NF1-201ENST00000356175 U3KQ87 197 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 HMX2A2RU54 273 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 LRRTM2O43300 516 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
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NF1-201ENST00000356175 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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NF1-201ENST00000356175 STK17BO94768 372 aa6.5□□□□□ -1.37
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NF1-201ENST00000356175 TMEM126BQ8IUX1 230 aa6.5□□□□□ -1.37
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NF1-201ENST00000356175 NT5C3BQ969T7 300 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 MIOSQ9NXC5 875 aa6.5□□□□□ -1.37
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NF1-201ENST00000356175 SLC6A5Q9Y345 797 aa6.5□□□□□ -1.37
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NF1-201ENST00000356175 CCSO14618 274 aa6.49□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 CDK14O94921 469 aa6.49□□□□□ -1.37
NF1-201ENST00000356175 CNIH1O95406 144 aa6.49□□□□□ -1.37
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