RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 HTR1EP28566 365 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 NOS3P29474 1203 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CD79BP40259 229 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GMFBP60983 142 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SLC14A1Q13336 389 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GPR19Q15760 415 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 IFNEQ86WN2 208 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 DHFR2Q86XF0 187 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CALHM3Q86XJ0 350 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 OR6S1Q8NH40 331 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 OR10A6Q8NH74 314 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SLC41A2Q96JW4 573 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CCDC74BQ96LY2 380 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MUC13Q9H3R2 512 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TAS2R9Q9NYW1 312 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GON4LQ3T8J9 2241 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 LNP1A1A4G5 178 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SH3PXD2BA1X283 911 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 HYKKA2RU49 373 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 WASHC1A8K0Z3 465 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MYO1GB0I1T2 1018 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FAM220BPB1ANY3 271 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TMEM150CB9EJG8 249 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 H3BMH7 237 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 NTSP30990 170 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GZMMP51124 257 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 OR4D2P58180 307 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TSC22D1Q15714 1073 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 INAVAQ3KP66 663 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 DBX2Q6ZNG2 339 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 RAB11FIP2Q7L804 512 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 KIF18BQ86Y91 864 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PRSS58Q8IYP2 241 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 OR4D9Q8NGE8 314 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 OR9A4Q8NGU2 314 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SLC26A7Q8TE54 656 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZFP90Q8TF47 636 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CSF3RQ99062 836 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 DPYSL5Q9BPU6 564 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MS4A12Q9NXJ0 267 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 EGFL7Q9UHF1 273 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PSME2Q9UL46 239 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CROCCQ5TZA2 2017 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 EVPLLA8MZ36 301 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ARPC2O15144 300 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MITFO75030 526 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FKBP6O75344 327 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 RDH16O75452 317 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CPNE6O95741 557 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CAPNS1P04632 268 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ANKRD34CP0C6C1 535 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CLEC2LP0C7M8 214 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FOLR1P15328 257 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 UQCRC2P22695 453 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PPIBP23284 216 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GRK6P43250 576 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PGDP52209 483 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 EMP3P54852 163 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SKP1P63208 163 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FAM76BQ5HYJ3 339 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GARNL3Q5VVW2 1013 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 NIPAL1Q6NVV3 410 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 Q6ZNX1 250 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TPRA1Q86W33 373 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 KRT73Q86Y46 540 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 C10orf111Q8N326 155 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SLC37A3Q8NCC5 494 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 OR2T12Q8NG77 320 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 OR5T3Q8NGG3 340 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 NANPQ8TBE9 248 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 AMDHD1Q96NU7 426 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 BBS4Q96RK4 519 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SLC35A5Q9BS91 424 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 DCLRE1BQ9H816 532 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TPT1P8Q9HAU6 139 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PRDM9Q9NQV7 894 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 UFSP2Q9NUQ7 469 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SPACA6W5XKT8 324 aa5.68□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SCN3AQ9NY46 2000 aa5.67□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.67□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms