RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 TPBGQ13641 420 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 KIR2DS3Q14952 304 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 MFSD12Q6NUT3 480 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 SLC35A4Q96G79 324 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 MYADMQ96S97 322 aa18.32■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 MED18Q9BUE0 208 aa18.32■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 CERS4Q9HA82 394 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 INIPQ9NRY2 104 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 OR4K14Q8NGD5 310 aa18.31■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 CHD7Q9P2D1 2997 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 DOCK9Q9BZ29 2069 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 PEX5LQ8IYB4 626 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa18.31■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 ZG16BQ96DA0 208 aa18.31■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 KCTD7Q96MP8 289 aa18.31■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 TNFSF14O43557 240 aa18.3■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 PDX1P52945 283 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 TPTEP56180 551 aa18.3■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 OR7G2Q8NG99 324 aa18.3■□□□□ 0.52
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SPNS1-201ENST00000311008 ERVK13-1Q9NX77 482 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 CNIH4Q9P003 139 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 KCMF1Q9P0J7 381 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 FRS3O43559 492 aa18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 B3GALT2O43825 422 aa18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 APBB3O95704 486 aa18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 SMIM10L1P0DMW3 83 aa18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 SELENBP1Q13228 472 aa18.29■□□□□ 0.52
SPNS1-201ENST00000311008 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
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