RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 B4DXG7 233 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GABRPO00591 440 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PRODHO43272 600 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PTH2RP49190 550 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GPLD1P80108 840 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 P2RY14Q15391 338 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 WBP2Q969T9 261 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CREB3L1Q96BA8 519 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 NXPE2Q96DL1 559 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 INSL5Q9Y5Q6 135 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 MCIDASD6RGH6 385 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 RCBTB2O95199 551 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 JUNDP17535 347 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SUOXP51687 545 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 DPH7Q9BTV6 452 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CERS4Q9HA82 394 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.85□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 DISC1C4P0D8 188 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SLC25A12O75746 678 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GTF2F2P13984 249 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 LYPD4Q6UWN0 246 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CFAP77Q6ZQR2 320 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PMM1Q92871 262 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CENPMQ9NSP4 180 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZNF226Q9NYT6 803 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 LHX3Q9UBR4 397 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 IL1AP01583 271 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PCSK2P16519 638 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CTNNB1P35222 781 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SEC13P55735 322 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 MOSPD2Q8NHP6 518 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SLC7A13Q8TCU3 470 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PSD2Q9BQI7 771 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ASGR2P07307 311 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PCMT1P22061 227 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 AK4P27144 223 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 HOXC13P31276 330 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 KIAA1024LP59773 190 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PSPHP78330 225 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 KCNJ10P78508 379 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 VRK2Q86Y07 508 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 OR52E2Q8NGJ4 325 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 TMEM5Q9Y2B1 443 aa14.84□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CACNG3O60359 315 aa14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ETV5P41161 510 aa14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 ETV1P50549 477 aa14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 C2orf27AQ580R0 203 aa14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PTOV1Q86YD1 416 aa14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 GPER1Q99527 375 aa14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 COPS3Q9UNS2 423 aa14.83□□□□□ -0.03
USP43-201ENST00000285199 CIB4A0PJX0 185 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 DUXAA6NLW8 204 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 XKRYO14609 159 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 CMPK1P30085 196 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ZNF750Q32MQ0 723 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 SAXO2Q658L1 398 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 NLRP8Q86W28 1048 aa14.83□□□□□ -0.04
USP43-201ENST00000285199 ACER3Q9NUN7 267 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms