RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TAGAPQ8N103 731 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00471Q8N535 108 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TTLQ8NG68 377 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OR10G2Q8NGC3 310 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OR2L2Q8NH16 312 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF480Q8WV37 535 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FAR1Q8WVX9 515 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ASB12Q8WXK4 309 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OR1E3Q8WZA6 343 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC38A4Q969I6 547 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NEIL2Q969S2 332 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C5orf34Q96MH7 638 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF607Q96SK3 696 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PSD2Q9BQI7 771 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CHST8Q9H2A9 424 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NT5DC2Q9H857 520 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 APMAPQ9HDC9 416 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 EXD2Q9NVH0 621 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ICKQ9UPZ9 632 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SPG11Q96JI7 2443 aa6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 EFCAB10A6NFE3 127 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 A8MU76 341 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GUCY1B2O75343 617 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 STK17BO94768 372 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CCNB2O95067 398 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C6orf47O95873 294 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFP01375 233 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MT-ND2P03891 347 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 IFNW1P05000 195 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 INHBBP09529 407 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP4B1P13584 511 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NPPBP16860 134 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 AGXTP21549 392 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 HTR1BP28222 390 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CD1CP29017 333 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FMO3P31513 532 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 UGT2B10P36537 528 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 STAT5AP42229 794 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CCR8P51685 355 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TAS2R50P59544 299 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DSTNP60981 165 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNJ10P78508 379 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 VLDLRP98155 873 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CHAF1BQ13112 559 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MICAQ29983 383 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 WSCD2Q2TBF2 565 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM16LQ309B1 348 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 REEP3Q6NUK4 255 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 USP43Q70EL4 1123 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 AMZ2Q86W34 360 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT73Q86Y46 540 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 STX19Q8N4C7 294 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 BMPERQ8N8U9 685 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PATE1Q8WXA2 126 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SMPDL3AQ92484 453 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PROX1Q92786 737 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 VOPP1Q96AW1 172 aa6.6□□□□□ -1.35
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