RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 ILKQ13418 452 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 E2F2Q14209 437 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 MAPK14Q16539 360 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 TUBA1AQ71U36 451 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 RRM2BQ7LG56 351 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ZAR1Q86SH2 424 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 KLBQ86Z14 1044 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 NANOGP1Q8N7R0 232 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 MORN4Q8NDC4 146 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 OR13C5Q8NGS8 318 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 COX14Q96I36 57 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SAMD8Q96LT4 415 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ZNF559Q9BR84 538 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 NEK6Q9HC98 313 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 MED12Q93074 2177 aa8.13□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 LRRC72A6NJI9 287 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 C4orf47A7E2U8 309 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 CPMP14384 443 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 UGT2B10P36537 528 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 MAGEB1P43366 347 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 LIMK1P53667 647 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SGCGQ13326 291 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ARL14Q8N4G2 192 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 TMEM52Q8NDY8 209 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 OR51A7Q8NH64 312 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 CHAC2Q8WUX2 184 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SMARCD2Q92925 531 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SLC35B4Q969S0 331 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SLC35A4Q96G79 324 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 C19orf43Q9BQ61 176 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 TMEM168Q9H0V1 697 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SLC7A7Q9UM01 511 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ASB4Q9Y574 426 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 A0A087WV48 116 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 A0A0B4J293 547 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 FAAHO00519 579 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 DMPKQ09013 629 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ERV3-1Q14264 604 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 C12orf73Q69YU5 71 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PLBD1Q6P4A8 553 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ASB18Q6ZVZ8 466 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 CPOQ8IVL8 374 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 RFLNBQ8N5W9 214 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 TMIEQ8NEW7 156 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 ANKK1Q8NFD2 765 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 OR2L3Q8NG85 312 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 UBE2E3Q969T4 207 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PSD2Q9BQI7 771 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SSR3Q9UNL2 185 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 GPR34Q9UPC5 381 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 FRYQ5TBA9 3013 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 FABP12A6NFH5 140 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 EPOPA6NHQ4 379 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 E9PI62 339 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 CASKO14936 926 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 VEGFDO43915 354 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 CTSVO60911 334 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 SEMA3DO95025 777 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PAHP00439 452 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 LIMS3P0CW19 117 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 LIMS4P0CW20 117 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 PPP2R1BP30154 601 aa8.12□□□□□ -1.11
GINS1-201ENST00000262460 NTSP30990 170 aa8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms