RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SCG5P05408 212 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 HSMCR30P0CW71 290 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CRATP43155 626 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 XCR1P46094 333 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SQSTM1Q13501 440 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SCARB2Q14108 478 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF19Q5T6S3 580 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 RNLSQ5VYX0 342 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 LCN9Q8WX39 176 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 MAL2Q969L2 176 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 WDFY2Q96P53 400 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 TGM7Q96PF1 710 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 DEPDC7Q96QD5 511 aa24.69■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35F4A4IF30 521 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM221BA6H8Z2 402 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 BTN3A3O00478 584 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDH7O60245 1069 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 RHCEP18577 417 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CBLP22681 906 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 AQP1P29972 269 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CAPZBP47756 277 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 MVDP53602 400 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 E2F2Q14209 437 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM71Q6P5X7 295 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC74BQ96LY2 380 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 MENTQ9BUN1 341 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG10Q9H0Y0 220 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SMURF1Q9HCE7 757 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 RLIMQ9NVW2 624 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 HRASLS2Q9NWW9 162 aa24.68■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf105O95561 183 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 DDOSTP39656 456 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 NR4A2P43354 598 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 MED22Q15528 200 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 TSTQ16762 297 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR48Q8TAF3 677 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 REEP4Q9H6H4 257 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ACER3Q9NUN7 267 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 MSRB2Q9Y3D2 182 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFS1P28331 727 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS5P46782 204 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SHC2P98077 582 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CARTPTQ16568 116 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 PTCHD4Q6ZW05 846 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 LILRB4Q8NHJ6 448 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SEC14L4Q9UDX3 406 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ENPP4Q9Y6X5 453 aa24.67■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 TRABD2BA6NFA1 517 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 GADD45GO95257 159 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFSF8P32971 234 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CRISP1P54107 249 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR50Q13585 617 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CLIP4Q8N3C7 705 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4D9Q8NGE8 314 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFPM2Q8WW38 1151 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 MTERF3Q96E29 417 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2A14Q96R47 310 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SRMSQ9H3Y6 488 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF167Q9H6Y7 350 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ANGPT4Q9Y264 503 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 APC2O95996 2303 aa24.66■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF33A8MVX0 844 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 E7EQ34 232 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 RCVRNP35243 200 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 RORCP51449 518 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB43Q86YS6 212 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF175Q8N4F7 328 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 C17orf50Q8WW18 174 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35A5Q9BS91 424 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3BP4Q9P0V3 963 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 NDOR1Q9UHB4 597 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5K3A6NET4 321 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK6Q00534 326 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF763Q0D2J5 394 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 NCF4Q15080 339 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf38Q5JPI3 329 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 FRMPD2BQ6IN97 320 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 UNC5DQ6UXZ4 953 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 AMIGO1Q86WK6 493 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01555Q8NAE3 123 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-201ENST00000246533 C1GALT1Q9NS00 363 aa24.65■■□□□ 1.54
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