RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 TRAM2Q15035 370 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 POMZP3Q6PJE2 187 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 OR5D16Q8NGK9 328 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TBC1D20Q96BZ9 403 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SERHL2Q9H4I8 314 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 DIABLOQ9NR28 239 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TAS2R7Q9NYW3 318 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa9.99□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MYO10Q9HD67 2058 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 C4orf47A7E2U8 309 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 H0YGG7 62 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 AK1P00568 194 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PROS1P07225 676 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 KCNJ10P78508 379 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MANEAQ5SRI9 462 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 NDC1Q9BTX1 674 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 A0A0A6YYD5 115 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PTPN6P29350 595 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CRISP1P54107 249 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RPS15P62841 145 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PLGLB1Q02325 96 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CORO6Q6QEF8 472 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TANKQ92844 425 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 BMFQ96LC9 184 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 DACH2Q96NX9 599 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 DGAT2Q96PD7 388 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PINK1Q9BXM7 581 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CDC14AQ9UNH5 594 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PPV9 198 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TNFRSF10AO00220 468 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 CHRNB1P11230 501 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PVRP15151 417 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 OTX2P32243 289 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GZMMP51124 257 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 GNG2P59768 71 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SHC2P98077 582 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PMS2P3Q13401 168 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SYPL1Q16563 259 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 C18orf63Q68DL7 685 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 Q6ZS52 159 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 LUZP2Q86TE4 346 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PAQR7Q86WK9 346 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 KBTBD8Q8NFY9 601 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 BORCS5Q969J3 196 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 FKBP10Q96AY3 582 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 OCEL1Q9H607 264 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PDE7BQ9NP56 450 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 AMBNQ9NP70 447 aa9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PR48 441 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RELAQ04206 551 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 LSAMPQ13449 338 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MLC1Q15049 377 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MED22Q15528 200 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SYT13Q7L8C5 426 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC37A2Q8TED4 501 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 BTBD2Q9BX70 525 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 HMG20AQ9NP66 347 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TVP23BQ9NYZ1 205 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 COQ3Q9NZJ6 369 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 FAM25AB3EWG3 89 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 FAM25CB3EWG5 89 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 FAM25GB3EWG6 89 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM150CB9EJG8 249 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RGS5O15539 181 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ITGA3P26006 1051 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 NOS3P29474 1203 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 ALDH3B2P48448 385 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 SLC16A1P53985 500 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 RPS7P62081 194 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 LSM3P62310 102 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 AMER2Q8N7J2 671 aa9.97□□□□□ -0.81
PRRX1-201ENST00000239461 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms