RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 UBDO15205 165 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 FREM3P0C091 2139 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 HSF1Q00613 529 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 DUSP5Q16690 384 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 GSTA3Q16772 222 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 DPY19L1Q2PZI1 675 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 TBCELQ5QJ74 424 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 GFRALQ6UXV0 394 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD46Q86W74 232 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 CLEC4FQ8N1N0 589 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 PRR7Q8TB68 274 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 FAM110BQ8TC76 370 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 RILPQ96NA2 401 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 YIPF4Q9BSR8 244 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 DOHHQ9BU89 302 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 CCDC28BQ9BUN5 200 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 NEUROD4Q9HD90 331 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ZFP64Q9NPA5 681 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 TCF7L2Q9NQB0 619 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 OR10H1Q9Y4A9 318 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 SNX8Q9Y5X2 465 aa20.41■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 COL12A1Q99715 3063 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 TFECO14948 347 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ABCB7O75027 752 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ICOSLGO75144 302 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 CELA3AP09093 270 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 CYP4B1P13584 511 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 MAGEA5P43359 124 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 MAN2A2P49641 1150 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ2P63252 427 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 PRR5P85299 388 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 RFWD2Q8NHY2 731 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 FBXO30Q8TB52 745 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 SFXN5Q8TD22 340 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 DEFB127Q9H1M4 99 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 GALNT9Q9HCQ5 603 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 Q9N2J8 555 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 FLRT3Q9NZU0 649 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ZIM2Q9NZV7 527 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 ZNF835Q9Y2P0 537 aa20.4■□□□□ 0.86
SYF2-201ENST00000236273 C2orf72A6NCS6 295 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 B4DXG7 233 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 CFLARO15519 480 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SEMA7AO75326 666 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A3O75751 556 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SNX4O95219 450 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 IL33O95760 270 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 C1QCP02747 245 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 PGRP06401 933 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 STSP08842 583 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 S100A3P33764 101 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 GAS1P54826 345 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 GUCY1A3Q02108 690 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 PLGLB1Q02325 96 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ANXA8L1Q5VT79 327 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 PAOXQ6QHF9 649 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ACAD11Q709F0 780 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SZRD1Q7Z422 152 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SLC22A16Q86VW1 577 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 OR56A1Q8NGH5 318 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 OR9I1Q8NGQ6 314 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 OR5AK3PQ8NH89 298 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SLC9A6Q92581 669 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 TMEM41AQ96HV5 264 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 CCDC115Q96NT0 180 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SERHL2Q9H4I8 314 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 FBXO34Q9NWN3 711 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 OSGIN2Q9Y236 505 aa20.39■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 FADS1O60427 444 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 IGHG3P01860 377 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 RPP38P78345 283 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SNTA1Q13424 505 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 EFR3AQ14156 821 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 SLC30A6Q6NXT4 461 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 GHDCQ8N2G8 530 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 FAM109AQ8N4B1 249 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 OR4A15Q8NGL6 344 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 GPR151Q8TDV0 419 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 STON2Q8WXE9 905 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 TMCO6Q96DC7 493 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 GNRHR2Q96P88 292 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 RTN4RQ9BZR6 473 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 UBQLN3Q9H347 655 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 GIN1Q9NXP7 522 aa20.38■□□□□ 0.85
SYF2-201ENST00000236273 BTNL2Q9UIR0 455 aa20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms