RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CPTPQ5TA50 214 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMKVQ8NCB2 501 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2L5Q8NG80 312 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM125Q96AQ2 219 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SDCCAG3Q96C92 435 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 MS4A6EQ96DS6 147 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1F2PQ96R84 312 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ROGDIQ9GZN7 287 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 MUC13Q9H3R2 512 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 DCLRE1BQ9H816 532 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SERHLQ9NQF3 203 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 HCFC1P51610 2035 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 DNHD1Q96M86 4753 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ACOT8O14734 319 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 FKBP6O75344 327 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE5AO76074 875 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 SCELO95171 688 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ZCCHC18P0CG32 403 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 COX7A2P14406 83 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF24P17028 368 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 WNT3P56703 355 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 TFF3Q07654 80 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD17CQ6PCB6 329 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ASPGQ86U10 573 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD27Q96NW4 1050 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNC2Q96PR1 638 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 CMTM6Q9NX76 183 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-216ENST00000628306 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 PRORSD1PA6NEY8 169 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 URADA6NGE7 173 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK2AP1O14519 115 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 GUCY1B2O75343 617 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 ENTPD5O75356 428 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3BGRLO75368 114 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GALT4O96024 378 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4D2P58180 307 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS1Q08116 209 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 BNIP2Q12982 314 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 HEPACAMQ14CZ8 416 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 FXNQ16595 210 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 PGS1Q32NB8 556 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 RUNDC3AQ59EK9 446 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 ARMC10Q8N2F6 343 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 HORMAD2Q8N7B1 307 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TM4SF18Q96CE8 201 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC115Q96NT0 180 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 DUSP26Q9BV47 211 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R7Q9NYW3 318 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SLAMF8Q9P0V8 285 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0A6YYD5 115 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SAP18O00422 153 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 AKAP10O43572 662 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 FHP07954 510 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 DRD2P14416 443 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 IL10P22301 178 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPK12P53778 367 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 MLF1P58340 268 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R50P59544 299 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf80Q0P641 193 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 OR7A2PQ8NGA2 310 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT8Q8WV74 236 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDM7Q9NQW5 492 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 NME4O00746 187 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 PRRG2O14669 202 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 LRATO95237 230 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35G6P0C7Q6 338 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 SMIM10L1P0DMW3 83 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 LAMP1P11279 417 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 DDCP20711 480 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPN6P29350 595 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4F3Q6IEY1 312 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLM1Q8NBJ4 401 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM57AQ8TBR7 257 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 STMN2Q93045 179 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 GAL3ST3Q96A11 431 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-216ENST00000628306 POM121Q96HA1 1249 aa22.3■■□□□ 1.16
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