RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 HEXBP07686 556 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 CD247P20963 164 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 PSG6Q00889 435 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP7Q16829 419 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC36Q1X8D7 754 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 LANCL3Q6ZV70 420 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT73Q86Y46 540 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 ARMC8Q8IUR7 673 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 SMYD1Q8NB12 490 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 OR14A16Q8NHC5 309 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 C16orf52Q8NHV5 167 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 C7orf34Q96L11 122 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 COL21A1Q96P44 957 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR54Q9H977 334 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 PISDQ9UG56 409 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 DTX4Q9Y2E6 619 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 PEX1O43933 1283 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS23O95084 383 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 DDAH2O95865 285 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV3-11P04433 115 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 JMJD7P0C870 316 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 GABRA3P34903 492 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 VLDLRP98155 873 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRNEQ04844 493 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 IFI44LQ53G44 452 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 COX18Q8N8Q8 333 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A12Q8TD20 617 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR151Q8TDV0 419 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 RASSF5Q8WWW0 418 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 PIK3R3Q92569 461 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SDF2Q99470 211 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL4Q9C0H6 718 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 VCX3BQ9H321 246 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 PLD2O14939 933 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ALOX12BO75342 701 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 AK1P00568 194 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CST1P01037 141 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 FABP3P05413 133 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CYC1P08574 325 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 EMP2P54851 167 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC37A1P57057 533 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 IQCCQ4KMZ1 466 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 DCST2Q5T1A1 773 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF321PQ8N8H1 164 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF721Q8TF20 911 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 MR1Q95460 341 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 BDH2Q9BUT1 245 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 NTN4Q9HB63 628 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJB9Q9UBS3 223 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SEC14L3Q9UDX4 400 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 PRODH2Q9UF12 536 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 PADI2Q9Y2J8 665 aa23.13■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC36A6NLP5 189 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 FCMRO60667 390 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC5A2P31639 672 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNJ5P48544 419 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 HPCAP84074 193 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 FAAH2Q6GMR7 532 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM198BQ6UWH4 519 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 FRRS1Q6ZNA5 592 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD37Q7Z713 158 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT6Q8NCL4 622 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ICA1LQ8NDH6 482 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 CATSPER1Q8NEC5 780 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR32P1Q8NGA4 272 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ART5Q96L15 291 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8D2Q9GZM6 311 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF350Q9GZX5 532 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf18Q9UK00 162 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 BAG5Q9UL15 447 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa23.12■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 GXYLT2A0PJZ3 443 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 STK17BO94768 372 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 FTH1P19P0C7X4 201 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 GRAMD1BQ3KR37 738 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 AP1ARQ63HQ0 302 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 NPSR1Q6W5P4 371 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 KBTBD2Q8IY47 623 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SPPL2AQ8TCT8 520 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 EME1Q96AY2 570 aa23.11■■□□□ 1.29
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC46A1Q96NT5 459 aa23.11■■□□□ 1.29
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