RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597047.1

ZNF548-206, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF548, Length 682 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-206ENST00000597047 EBAG9O00559 213 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 FBP2O00757 339 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 PDGFAP04085 211 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 PPICP45877 212 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 CYB561P49447 251 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 KHKP50053 298 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 NUDT2P50583 147 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 SOX8P57073 446 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 FBXW4P57775 412 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 MTPNP58546 118 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 DCAF7P61962 342 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 TUBA3CQ13748 450 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 OR1C1Q15619 314 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 DUSP5Q16690 384 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 GPAT3Q53EU6 434 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 COX20Q5RI15 118 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 H3F3CQ6NXT2 135 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 TUBA3EQ6PEY2 450 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 OPN5Q6U736 354 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 NPSR1Q6W5P4 371 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 C16orf62Q7Z3J2 963 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 FITM2Q8N6M3 262 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 CDRT4Q8N9R6 151 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 TEX19Q8NA77 164 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 OR8K3Q8NH51 312 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 NUBPLQ8TB37 319 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 TM9SF4Q92544 642 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 TTC9Q92623 222 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 TP53INP1Q96A56 240 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 GIMAP5Q96F15 307 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 SLC35A4Q96G79 324 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 VSTM2LQ96N03 204 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 ADOQ96SZ5 270 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 HES7Q9BYE0 225 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 GID8Q9NWU2 228 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 CBLCQ9ULV8 474 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.59□□□□□ -1.03
ZNF548-206ENST00000597047 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 OR5H15A6NDH6 313 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 FRG2CA6NGY1 282 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 CAPN14A8MX76 684 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 NPIPA7E9PJI5 369 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 SLC28A2O43868 658 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 GMFGO60234 142 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 HS6ST1O60243 411 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 DPM1O60762 260 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 CEACAM4O75871 244 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 UNC5CO95185 931 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 KRT16P08779 473 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 NPIPA8P0DM63 369 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 CT45A8P0DMV1 189 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 CT45A9P0DMV2 189 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 NR2F1P10589 423 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 ETFAP13804 333 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 ATP6V1C1P21283 382 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 DRD5P21918 477 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 ABCD3P28288 659 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 CD97P48960 835 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 HLCSP50747 726 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 GPR85P60893 370 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 PSG6Q00889 435 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 SELPLGQ14242 412 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 GPR68Q15743 365 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 DECR1Q16698 335 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 PRAMEF20Q5VT98 475 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 SAXO2Q658L1 398 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 CDC73Q6P1J9 531 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 MDGA2Q7Z553 956 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 HMGN2P46Q86SG4 172 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 IFNEQ86WN2 208 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 SLC34A3Q8N130 599 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 HORMAD2Q8N7B1 307 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 ZNF614Q8N883 585 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 BCORP1Q8N888 145 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 PSMA8Q8TAA3 256 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 ZFP90Q8TF47 636 aa8.58□□□□□ -1.04
ZNF548-206ENST00000597047 DIO2Q92813 273 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms