RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 A0A0G2JNG1 304 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 A6NL46 340 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 HSPB6O14558 160 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 RAD1O60671 282 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 UGDHO60701 494 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 AP2A2O94973 939 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 TGDSO95455 350 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 TPOP07202 933 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 OR56A5P0C7T3 313 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 ERVK-10P10266 1014 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 THRAP10827 490 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 SLC1A2P43004 574 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 FASLGP48023 281 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 TTPAP49638 278 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 LIMK2P53671 638 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 NAE1Q13564 534 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 KIR2DS5Q14953 304 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 DCAF12Q5T6F0 453 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM198Q66K66 360 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 NEPROQ6NW34 567 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 SLC2A7Q6PXP3 512 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CENPUQ71F23 418 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 SLC9B2Q86UD5 537 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 KCNMB4Q86W47 210 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 ZBED8Q8IZ13 594 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 PDIK1LQ8N165 341 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 OR4D9Q8NGE8 314 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 HEXDCQ8WVB3 486 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 ELMO1Q92556 727 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 LPGAT1Q92604 370 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 NRTNQ99748 197 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 P2RY12Q9H244 342 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 KLK15Q9H2R5 256 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 VPS37BQ9H9H4 285 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM9Q9P0T7 183 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 TEX264Q9Y6I9 313 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 FBN2P35556 2912 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 C1orf226A1L170 272 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 MAGEB16A2A368 324 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 OGG1O15527 345 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 DUX1O43812 170 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 KCNJ13O60928 360 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 NIPSNAP2O75323 286 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 JRKO75564 520 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 FTH1P02794 183 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 SLC35G4P0C7Q5 338 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CTAGE8P0CG41 777 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 OGNP20774 298 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CD1CP29017 333 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 PLTPP55058 493 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 GUCY2DQ02846 1103 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CALCOCO2Q13137 446 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 GPR18Q14330 331 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 TYSND1Q2T9J0 566 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 SPANXN3Q5MJ09 141 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 WASH2PQ6VEQ5 465 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 Q6ZPA2 131 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 CTAGE4Q8IX94 777 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 MMGT1Q8N4V1 131 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 FBXO36Q8NEA4 188 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 FBXO25Q8TCJ0 367 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 STARD8Q92502 1023 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4D-210ENST00000588972 C12orf66Q96MD2 445 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.8 ms